Table 2.

Replication^a of BMI–DNA methylation associations in the FHS (Cohorts I and II) and GOLDN cohorts, in order of meta-analysis P-value

CpG marker	CHR	Closest gene	ARIC (discovery cohort) analysis		Replication meta-analysis (FHS I + FHS II + GOLDN)		Discovery + replication cohort meta-analysis
			ARIC regression coefficient	ARIC P-value	Replication z statistic	Replication P-value	Direction	Summary P-value	HetISq	HetChiSq	HetPVal
cg00574958	11	CPT1A	−0.0029	3.23E − 12	−12.881	5.77E − 38	−−−−	3.44E − 47	55.9	6.801	0.0785
cg06500161	21	ABCG1	0.0081	1.52E − 13	12.456	1.29E − 35	++++	1.01E − 46	77.8	13.543	0.0036
cg03078551	17	NA	−0.0026	7.49E − 09	−9.399	5.52E − 21	−−−−	6.03E − 28	1.4	3.042	0.3851
cg11024682	17	SREBF1	0.0068	9.58E − 09	8.424	3.63E − 17	++++	2.76E − 24	55.6	6.755	0.0801
cg13123009	6	LY6G6E;LY6G6D	0.0069	1.80E − 11	6.894	5.41E − 12	++++	1.01E − 21	0	1.657	0.6466
cg04927537	17	LGALS3BP	0.0108	5.91E − 10	7.17	7.48E − 13	++++	2.93E − 21	0	2.45	0.4845
cg27243685	21	ABCG1	0.0057	3.61E − 08	7.661	1.85E − 14	++++	4.23E − 21	61.3	7.747	0.0515
cg26403843	5	RNF145	0.0099	1.06E − 08	6.934	4.09E − 12	++++	2.51E − 19	0	0.567	0.9040
cg09349128	22	NA	−0.0059	1.44E − 08	−6.92	4.51E − 12	−−−−	3.76E − 19	0	0.507	0.9173
cg07814318	15	KLF13	0.0081	2.33E − 10	5.896	3.73E − 09	++++	1.19E − 17	73.8	11.445	0.0095
cg07573872	19	SBNO2	−0.0069	2.80E − 08	−6.377	1.80E − 10	−−−−	3.00E − 17	0	0.683	0.8771
cg13708645	12	KDM2B	0.0096	4.68E − 10	5.74	9.48E − 09	++++	6.03E − 17	60.7	7.631	0.0543
cg25178683	17	LGALS3BP	0.0087	1.67E − 08	6.138	8.36E − 10	++++	9.25E − 17	0	0.869	0.8328
cg12992827	3	NA	−0.0075	5.31E − 09	−5.939	2.87E − 09	−−−−	1.25E − 16	47.3	5.693	0.1275
cg09664445	17	KIAA0664	0.0055	8.89E − 09	5.93	3.03E − 09	++++	2.08E − 16	65.4	8.672	0.0340
cg06876354	2	RALB	0.0057	1.02E − 09	5.62	1.91E − 08	++++	2.53E − 16	39	4.916	0.1780
cg23998749	1	NA	0.0052	5.66E − 08	5.92	3.22E − 09	++++	1.14E − 15	40.4	5.035	0.1692
cg06192883	15	MYO5C	0.0065	5.29E − 08	5.791	7.01E − 09	++++	2.45E − 15	0	0.979	0.8062
cg26033520	10	NA	0.0070	1.44E − 08	5.578	2.43E − 08	++++	3.01E − 15	0	1.065	0.7856
cg07136133	11	PRR5L	−0.0048	6.70E − 09	−5.36	8.34E − 08	−−−−	6.24E − 15	0	1.871	0.5996
cg08972190	7	MAD1L1	0.0054	6.43E − 10	5.054	4.33E − 07	++++	6.42E − 15	27.7	4.149	0.2458
cg06946797	16	NA	−0.0070	8.35E − 09	−5.131	2.88E − 07	−−−−	3.04E − 14	17.2	3.622	0.3052
cg18568872	15	ZNF710	0.0062	3.74E − 10	4.709	2.49E − 06	++++	3.54E − 14	66.8	9.04	0.0288
cg15871086	18	NA	0.0062	8.31E − 11	4.354	1.34E − 05	++++	1.00E − 13	67.5	9.226	0.0264
cg08857797	17	VPS25	0.0063	3.40E − 09	4.74	2.14E − 06	++++	1.55E − 13	39.9	4.99	0.1725
cg20954977	2	B3GNT7	0.0101	1.68E − 08	4.898	9.66E − 07	++++	2.13E − 13	21.3	3.811	0.2826
cg04816311	7	C7orf50	0.0090	2.56E − 12	3.823	1.32E − 04	++++	2.18E − 13	77.1	13.094	0.0044
cg14017402	2	NA	0.0080	1.47E − 10	4.226	2.38E − 05	++++	3.17E − 13	75.9	12.462	0.0060
cg17560136	8	EPB49	0.0063	3.03E − 08	4.824	1.41E − 06	++++	5.27E − 13	25.3	4.018	0.2595
cg11592786	15	NA	−0.0031	3.60E − 08	−4.584	4.56E − 06	−−−−	2.36E − 12	14.8	3.52	0.3181
cg01844514	7	ZNF862	0.0046	3.17E − 08	4.27	1.96E − 05	++++	1.21E − 11	4.5	3.143	0.3701
cg18307303	5	IL12B	0.0044	4.67E − 08	4.217	2.48E − 05	++++	2.16E − 11	46.4	5.592	0.1332
cg04869770	1	PBX1	0.0057	5.65E − 09	3.805	1.42E − 04	++++	4.23E − 11	57.6	7.074	0.0696
cg00863378	16	BBS2	0.0055	1.91E − 08	3.967	7.27E − 05	++++	4.24E − 11	49.5	5.939	0.1146
cg26354221	22	ADORA2A	0.0032	1.39E − 08	3.725	1.95E − 04	++++	1.20E − 10	52.7	6.343	0.0961
cg15695155	12	KDM2B	0.0079	4.03E − 08	3.802	1.43E − 04	++++	1.71E − 10	49	5.883	0.1175
cg27614723	15	SLCO3A1	0.0071	5.62E − 08	3.62	2.94E − 04	++++	5.44E − 10	39.4	4.947	0.1757

^aSuccessful replication was defined as consistent direction of association across all four studies (ARIC, FHS I, FHS II and GOLDN) and P < 0.05/76 (<6.6 × 10⁻⁴) in the replication meta-analysis. Meta-analysis used Stouffer's Z for trend test, which is based on meta-analysis of P-values with adjustment for cohort sample size and direction.