Table 2.
miR family | Monocot | Dicot | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
a | b | f | h | o | s | s | t | t | z | a | a | a | a | a | a | a | a | b | b | b | b | c | c | c | c | c | c | d | g | g | g | g | h | h | h | h | h | l | m | m | m | n | p | p | p | r | s | s | s | v | v | |
t | d | a | v | s | s | b | a | t | m | a | m | t | q | l | t | h | m | n | r | c | g | p | c | r | s | t | m | p | m | s | h | h | a | e | p | t | b | j | d | e | t | t | v | t | p | c | s | l | t | u | v | |
a | i | r | u | a | p | i | e | u | a | u | g | r | c | y | h | y | a | a | a | y | y | a | l | t | i | r | e | r | a | o | b | r | r | x | a | u | r | a | m | s | r | a | u | c | e | o | l | y | u | n | i | |
#miR1432 | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR156a | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR156b | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR156c-f | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||
$&miR156g-h | @ | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR159 | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR160a | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR160b-f | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||
&miR164a-b | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||
&miR164c | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR166a-b | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR166c-i | + | + | + | + | @ | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||
&miR166j-k | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR167a-c | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||
&miR167d-e | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||
&miR167f-j | + | + | @ | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR169a | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR169b | @ | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR169c | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR169d-l | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||
&miR171a-b | + | @ | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR171c-f | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||
&miR172a-c | + | + | + | @ | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR2118a-b | + | + | @ | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR2118c | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
$#miR2118d | @ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR2118e | + | + | @ | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR2275 | + | @ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR319a-b | + | @ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR390 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||
&miR393a-b | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||
&miR394a-b | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||
#miR395 | + | @ | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR396a | + | + | + | + | @ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR396b-c | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||
&miR396d-e | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||
&miR396f | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||
#miR398 | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR399a | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR399b-d | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR399e | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR399f | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
&miR399g | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
$#miR437 | @ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR529 | + | @ | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
$#miR5385 | @ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR5564a-b | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
$#miR6221 | @ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
#miR6230a-b | + |
+, Known miRNAs; @, miRNAs reported first time in sorghum; #, Monocot specific miRNAs; &, miRNAs conserved in both monocot and dicot; $, miRNAs reported first time in monocot. β ata, Aegilops tauschii; bdi, Brachypodium distachyon; far, Festuca arundinacea; hvu, Hordeum vulgare; osa, Oryza sativa; ssp, Saccharum sp.; sbi, Sorghum bicolor; tae, Triticum aestivum; ttu, Triticum turgidum; zma, Zea mays; aau, Acacia auriculiformis; amg, Acacia mangium; atr, Amborella trichopoda; aqc, Aquilegia caerulea; aly, Arabidopsis lyrata; ath, Arabidopsis thaliana; ahy, Arachis hypogaea; ama, Avicennia marina; bna, Brassica napus; bra, Brassica rapa; bcy, Bruguiera cylindrica; bgy, Bruguiera gymnorhiza; cpa, Carica papaya; ccl, Citrus clementina; crt, Citrus reticulata; csi, Citrus sinensis; ctr, Citrus trifoliata; cme, Cucumis melo; dpr, Digitalis purpurea; gma, Glycine max; gso, Glycine soja; ghb, Gossypium herbaceum; ghr, Gossypium hirsutum; har, Helianthus argophyllus; hex, Helianthus exilis; hpa, Helianthus paradoxus; htu, Helianthus tuberosus; hbr, Hevea brasiliensis; lja, Lotus japonicus; mdm, Malus domestica; mes, Manihot esculenta; mtr, Medicago truncatula; nta, Nicotiana tabacum; pvu, Phaseolus vulgaris; ptc, Populus trichocarpa; ppe, Prunus persica; rco, Ricinus communis; ssl, Salvia sclarea; sly, Solanum lycopersicum; stu, Solanum tuberosum; vun, Vigna unguiculata; vvi, Vitis vinifera.