Table 2. Comparison of amino acid mutational sites in twelve glycoproteins of the twenty-two ILTV strains.
ORF | Amino acid sites | Conserved amino acid | LJS09 | K317 | WG | SA2 | A20 | Serva | ACC78 | CL-9 | V1-99 | CSW-1 | 1874C5 | USDA | 81658 | 63140 | LT Blen | Laryngo | CEO Low | CEO High | CEO TRVX | TCO Low | TCO High | TCO IVAX |
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gB | 44 | R | H | H | H | H | H | H | H | |||||||||||||||
gB | 71 | R | ||||||||||||||||||||||
gB | 116 | A | V | V | ||||||||||||||||||||
gB | 207 | F | ||||||||||||||||||||||
gB | 242 | Y | H | |||||||||||||||||||||
gB | 348 | M | ||||||||||||||||||||||
gB | 496 | R | ||||||||||||||||||||||
gB | 551 | M | V | V | V | V | V | |||||||||||||||||
gB | 644 | I | ||||||||||||||||||||||
gB | 707 | F | ||||||||||||||||||||||
gB | 799 | P | ||||||||||||||||||||||
gB | 805 | K | ||||||||||||||||||||||
gB | 809 | E | - | |||||||||||||||||||||
gC | 17 | S | N | N | ||||||||||||||||||||
gC | 76 | Y | ||||||||||||||||||||||
gC | 108 | I | T | |||||||||||||||||||||
gD | 137 | V | L | L | L | L | ||||||||||||||||||
gD | 141 | P | S | S | S | S | ||||||||||||||||||
gD | 145 | V | L | L | ||||||||||||||||||||
gD | 155 | F | ||||||||||||||||||||||
gD | 158 | T | N | N | N | N | ||||||||||||||||||
gD | 194 | Q | R | R | ||||||||||||||||||||
gD | 222 | D | ||||||||||||||||||||||
gD | 234 | G | R | R | R | R | ||||||||||||||||||
gD | 311 | D | N | |||||||||||||||||||||
gD | 350 | M | I | I | ||||||||||||||||||||
gD | 376 | R | ||||||||||||||||||||||
gE | 210 | R | ||||||||||||||||||||||
gE | 267 | V | A | A | A | A | A | |||||||||||||||||
gE | 386 | T | ||||||||||||||||||||||
gE | 420 | P | L | |||||||||||||||||||||
gE | 424 | N | S | |||||||||||||||||||||
gG | 45 | I | L | L | L | |||||||||||||||||||
gG | 58 | V | G | G | G | G | G | |||||||||||||||||
gG | 73 | E | D | |||||||||||||||||||||
gG | 98 | H | ||||||||||||||||||||||
gG | 113 | A | ||||||||||||||||||||||
gG | 115 | V | ||||||||||||||||||||||
gG | 118 | A | V | V | V | |||||||||||||||||||
gG | 121 | A | V | V | ||||||||||||||||||||
gG | 129 | Q | H | H | H | |||||||||||||||||||
gG | 220 | G | ||||||||||||||||||||||
gG | 262 | E | ||||||||||||||||||||||
gG | 274 | R | K | |||||||||||||||||||||
gG | 284 | F | L | L | L | L | L | |||||||||||||||||
gG | 291 | Q | R | R | R | |||||||||||||||||||
gH | 355 | E | ||||||||||||||||||||||
gH | 401 | H | R | R | R | R | R | R | R | |||||||||||||||
gH | 452 | D | ||||||||||||||||||||||
gH | 455 | Y | H | |||||||||||||||||||||
gH | 566 | I | V | V | V | V | ||||||||||||||||||
gH | 568 | L | ||||||||||||||||||||||
gH | 605 | N | H | H | H | H | ||||||||||||||||||
gH | 697 | Q | ||||||||||||||||||||||
gH | 711 | L | ||||||||||||||||||||||
gH | 778 | R | S | |||||||||||||||||||||
gI | 14 | T | ||||||||||||||||||||||
gI | 38 | H | R | |||||||||||||||||||||
gI | 39 | I | V | V | V | V | V | |||||||||||||||||
gI | 40 | V | A | |||||||||||||||||||||
gI | 109 | E | ||||||||||||||||||||||
gI | 178 | A | ||||||||||||||||||||||
gI | 185 | L | F | F | F | F | F | |||||||||||||||||
gI | 211 | A | T | T | T | |||||||||||||||||||
gI | 212 | T | P | P | P | P | P | |||||||||||||||||
gI | 224 | V | I | I | I | |||||||||||||||||||
gI | 253 | P | H | H | ||||||||||||||||||||
gI | 358 | D | E | E | ||||||||||||||||||||
gJ | 8 | R | H | H | H | H | ||||||||||||||||||
gJ | 74 | I | T | |||||||||||||||||||||
gJ | 88 | G | ||||||||||||||||||||||
gJ | 162 | R | ||||||||||||||||||||||
gJ | 163 | G | D | |||||||||||||||||||||
gJ | 257 | P | L | L | ||||||||||||||||||||
gJ | 264 | M | ||||||||||||||||||||||
gJ | 293 | V | ||||||||||||||||||||||
gJ | 301 | M | I | I | I | I | I | |||||||||||||||||
gJ | 318 | M | ||||||||||||||||||||||
gJ | 337 | R | G | G | G | |||||||||||||||||||
gJ | 340 | A | ||||||||||||||||||||||
gJ | 359 | T | P | P | ||||||||||||||||||||
gJ | 426 | T | A | A | A | |||||||||||||||||||
gJ | 463 | A | V | V | ||||||||||||||||||||
gJ | 494 | A | V | V | V | V | V | |||||||||||||||||
gJ | 502 | A | D | D | D | |||||||||||||||||||
gJ | 520 | Q | ||||||||||||||||||||||
gJ | 584 | R | W | W | ||||||||||||||||||||
gJ | 600 | E | G | G | G | |||||||||||||||||||
gJ | 643 | P | ||||||||||||||||||||||
gJ | 647 | T | I | I | I | |||||||||||||||||||
gJ | 661–670 | - | STVPEITQTP | STVPEITQTP | STVPEITQTP | STVPEITQTP | ||||||||||||||||||
gJ | 694 | A | ||||||||||||||||||||||
gJ | 715 | V | M | M | ||||||||||||||||||||
gJ | 719 | P | Q | Q | ||||||||||||||||||||
gJ | 887 | L | F | F | F | F | F | |||||||||||||||||
gK | 216 | V | I | I | ||||||||||||||||||||
gL | 8 | P | ||||||||||||||||||||||
gL | 126 | P | Q | Q | Q | |||||||||||||||||||
gL | 141 | P | Q | |||||||||||||||||||||
gL | 202 | A | V | V | ||||||||||||||||||||
gM | 23 | A | ||||||||||||||||||||||
gM | 32 | C | ||||||||||||||||||||||
gM | 229 | P | ||||||||||||||||||||||
gM | 236 | M | ||||||||||||||||||||||
gM | 350 | K | ||||||||||||||||||||||
gN | 16 | V | M | M | M | |||||||||||||||||||
gN | 40 | Y | H | H | H |
Note:
1. Bold (except bold italic) (A) represents the mutational sites were found only in single strain.
2. Italic (A) represents the mutational sites were found in strains WG, SA2, and A20.
3. Bold italic (A) represents the mutational sites were found among WG strain and Australia strains.
4. Underline (A and A) represents the mutational sites were found only in Australia strains.
5. Character border ( and ) represents the mutational sites were found in Chinese strains.
6. Emphasis mark ( and ) represents the mutational sites were found only in USA strains.
7. Light grey () represents the mutational sites were found among Chinese strains, USA strains and Australia strains.