Table 1.

The top five regulatory hubs for specific phases in the response of Chlamydomonas to N deprivation

	BTS specific hubs					ATS specific hubs					Permanent hubs
Metabolic pathway regulated	VARL12	HB2	GNAT1	bHLH9	GNAT7	FHA10	CSD1	AP2-15	MYBL13	SBP8	RWP1	RWP10	TAZ2	MYBL5	GATA11
Photosynthesis	•	•	•			•	•	•	•		•	•	•	•	•
Nitrogen	•			•	•	•	•	•		•	•	•	•	•
Chlorophyll biosynthesis		•	•	•	•	•	•				•	•	•	•	•
Photorespiration	•	•		•	•			•		•	•	•	•
OPPP	•	•	•	•	•					•	•	•
Calvin cycle	•	•		•	•			•		•	•	•	•
Carbohydrates	•	•		•		•			•		•	•	•
Central metabolism	•	•		•	•	•	•				•	•			•
Amino acids	•	•	•	•		•	•	•	•	•	•	•		•	•
Lipids	•	•		•	•	•		•	•	•	•	•	•		•
Degree of centrality	67	74	25	40	45	56	46	26	25	32	60	55	59	36	64