Table 2.
Gene | Number of cases | UPEC isolates | Phylogenetic groups of UPEC isolates | Commensal E. coli isolates | Phylogenetic groups of commensal E. coli isolates | ||||||
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A | B1 | B2 | D | A | B1 | B2 | D | ||||
138 (%) | 17 (%) | 16 (%) | 76 (%) | 29 (%) | 30 (%) | 9 (%) | 0 (%) | 9 (%) | 12 (%) | ||
set | 2 (1.3) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (2.6) | 0 (0) | 0(0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
sen | 13 (9.4) | 1 (5.8) | 2 (12.5) | 4 (5.2) | 6 (20.7) | 2(6.6) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (22) | 0 (0) | |
astA | 13 (9.4) | 1 (5.8) | 2 (12.5) | 9 (11.8) | 1 (3.4) | 5 (16.6) | 0 (0) | 0 (0) | 4 (44) | 1 (8) | |
cdtB | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
astA+sen | 3 (2.2) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (3.9) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
UPEC, uropathogenic E. coli .