Table 5.
Ten significant cancer modules identified using GSEA. The first column is the gene symbol, and the other columns indicate if a gene belongs to a specific cancer module. “X” shows that a gene belongs to that module, and a blank cell means that a gene does not belong to a specific module.
| GENE SYMBOL | CANCER MODULE NUMBER (OR ID) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 38 | 334 | 100 | 137 | 66 | 11 | 55 | 88 | 41 | 37 | |
| GRK5 | X | X | ||||||||
| TRPM2 | X | X | X | X | X | X | X | X | ||
| NRG2 | X | X | X | X | X | X | X | X | ||
| ALDH4A1 | X | X | X | X | X | X | X | |||
| PLXNA2 | X | X | X | X | X | X | ||||
| IQSEC1 | X | X | X | X | X | |||||
| COL6A2 | X | X | X | X | X | X | ||||
| SLMO1 | X | X | X | X | ||||||
| CNKSR1 | X | X | X | X | ||||||
| FBN2 | X | X | X | |||||||
| SLC38A10 | X | X | X | |||||||
| DNM2 | X | X | X | |||||||
| PLEC | X | X | X | |||||||
| ZBTB7A | X | X | X | |||||||
| TNFRSF10D | X | X | ||||||||
| PLXND1 | X | |||||||||
| LAMA5 | X | |||||||||
| TBX2 | X | |||||||||
| HOXB3 | X | |||||||||
| LTBP2 | X | |||||||||
| CDH15 | X | |||||||||
| KIAA0182 | X | |||||||||
| VAV2 | X | X | ||||||||
| DMD | X | |||||||||
| BMP6 | X | |||||||||
| FRMD4A | X | |||||||||
| LHX3 | X | |||||||||
| HS6ST1 | X | |||||||||
| OSBPL2 | X | |||||||||
| SNED1 | X | |||||||||
| MAP3K10 | X | |||||||||
| GRIN2C | X | |||||||||
| BAIAP2 | X | |||||||||
| CACNA1C | X | |||||||||
| GNG7 | X | X | X | X | X | X | X | |||
| CDH4 | X | X | X | X | X | X | X | |||
| PLCH2 | X | X | X | X | X | X | ||||
| SOX9 | X | X | X | X | X | X | ||||
| PTPRN2 | X | X | X | X | X | X | ||||
| CACNA2D2 | X | X | X | X | X | |||||
| GNG4 | X | X | X | X | X | |||||
| CDH22 | X | X | X | X | X | |||||
| GRIN1 | X | X | X | X | ||||||
| COL9A3 | X | X | X | X | ||||||
| CRMP1 | X | X | X | X | ||||||
| CTSF | X | X | X | X | ||||||
| ATP2B2 | X | X | X | X | ||||||
| PRPF6 | X | X | X | X | ||||||
| GABBR2 | X | X | X | X | ||||||
| DGCR2 | X | X | X | |||||||
| CA4 | X | X | X | |||||||
| ESR1 | X | X | X | |||||||
| SBNO2 | X | X | ||||||||
| KCNQ1 | X | X | ||||||||
| ATP11A | X | X | ||||||||
| ALDH1L1 | X | X | ||||||||
| TBCD | X | X | ||||||||
| COL18A1 | X | X | ||||||||
| CBS | X | X | ||||||||
| PEPD | X | X | ||||||||
| SLC22A1 | X | X | ||||||||
| GALNS | X | X | ||||||||
| MYBPC2 | X | |||||||||
| SLIT3 | X | |||||||||
| DIDO1 | X | |||||||||
| PCBP3 | X | |||||||||
| CAMK2B | X | |||||||||
| MLLT1 | X | |||||||||
| INTS9 | X | |||||||||
| PARD3 | X | |||||||||
| PLXNA3 | X | |||||||||
| GREB1 | X | |||||||||
| SDC3 | X | |||||||||
| ATP8A2 | X | |||||||||
| LMTK3 | X | |||||||||
| CCDC85C | X | |||||||||
| C9orf167 | X | |||||||||
| RNF220 | X | |||||||||
| BEGAIN | X | |||||||||
| ESPN | X | |||||||||
| OBSCN | X | |||||||||
| BCR | X | |||||||||
| PITPNC1 | X | |||||||||
| KIAA1522 | X | |||||||||
| RXRA | X | |||||||||
| LHPP | X | |||||||||
| MED24 | X | |||||||||