Skip to main content
. 2015 Aug 25;10(8):e0134472. doi: 10.1371/journal.pone.0134472

Table 1. Normalized scores of various docking programs and molecular descriptors.

Compounds pIC50 Goldscores Chem Score AutoDock score Auto Dock Vina Score DOCK6 Grid Score ASP Score LogP TPSA Vol Nrotb Consensus score
1 5.46 0.19 0.33 0.12 0.55 0.67 0.48 0.47 0.95 0.88 0.6 1.54
2 4.10 0.22 0.47 0.74 0.75 0.12 0.16 0.04 0.13 0.00 0.2 1.60
3 4.66 0.28 0.54 0.26 0.70 0.01 0.24 0.01 0.73 0.00 0.2 1.76
4 4.80 0.31 0.50 0.40 0.75 0.07 0.22 0.08 0.73 0.08 0.2 1.78
5 5.37 0.00 0.23 0.80 0.50 0.08 0.00 0.57 0.20 0.38 0.33 0.73
6 5.59 0.40 0.16 1.00 0.60 0.13 0.24 0.24 0.20 0.16 0.27 1.40
7 5.00 0.08 0.15 0.79 0.35 0.20 0.01 0.46 0.20 0.30 0.33 0.59
8 5.17 0.21 0.00 0.55 0.15 0.18 0.06 0.58 0.20 0.44 0.47 0.42
9 5.00 0.44 0.52 0.20 0.90 0.61 1.00 0.90 0.40 0.82 0.8 2.86
10 5.19 1.00 0.12 0.27 0.45 0.80 0.57 0.45 0.78 0.58 0.87 2.14
11 5.00 0.60 0.15 0.04 0.00 0.56 0.33 0.55 0.78 0.46 0.87 1.08
12 5.66 0.91 0.36 0.05 0.25 1.00 0.75 0.79 0.78 0.84 1 2.27
13 5.00 0.34 0.56 0.51 0.25 0.30 0.28 0.16 0.40 0.10 0.53 1.43
14 5.00 0.46 0.59 0.38 0.65 0.68 0.49 0.29 0.54 0.40 0.8 2.18
15 5.15 0.51 0.84 0.39 0.00 0.46 0.37 0.53 0.40 0.43 0.73 1.72
16 5.00 0.51 1.00 0.00 -0.05 0.91 0.68 0.54 0.43 0.64 0.87 2.14
17 9.05 0.57 0.65 0.34 0.80 0.21 0.21 0.51 1.00 0.51 0 2.23
18 6.49 0.37 0.35 0.32 0.85 0.00 0.50 0.48 0.14 0.04 0.2 2.07
19 6.74 0.24 0.42 0.36 1.00 0.01 0.51 0.52 0.00 0.09 0.2 2.17
20 7.46 0.24 0.77 0.28 0.75 0.19 0.34 0.63 0.00 0.13 0.2 2.10
21 6.03 0.59 0.63 0.15 0.55 0.04 0.51 0.00 0.38 0.02 0.07 2.28
22 7.48 0.54 0.67 0.17 0.60 0.00 0.41 0.44 0.19 0.18 0.07 2.22
23 8.40 0.61 0.81 0.13 0.80 0.06 0.65 0.36 0.19 0.15 0.07 2.87
24 7.51 0.54 0.73 0.08 0.60 0.05 0.60 0.37 0.19 0.15 0.07 2.47
25 7.66 0.40 0.62 0.78 1.00 0.32 0.77 1.00 0.20 0.90 0.4 2.79
26 8.30 0.40 0.76 0.77 0.80 0.51 0.73 0.96 0.20 0.92 0.47 2.70
27 8.10 0.41 0.74 0.80 0.90 0.44 0.75 0.97 0.34 1.00 0.4 2.80

After data normalization and calculation of consensus score, correlation coefficient between the activity (pIC50) and the consensus score was calculated. It was compared with correlation coefficient of all docking programs.