TABLE 4.
Number of sequences from sponge and water samples within specific nifH gene subclustersa
| Sample and speciesb | No. of sequences in the following subcluster: |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A | 1E | 1G | 1K | 3E | 3G | 3H | 3I | 3J | 3L | 3P | 3Q | 3S | 4A | 4F | |
| Water | |||||||||||||||
| May 1 | 1 | 1 | 4 | 3 | 5 | ||||||||||
| May 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | ||||||||||
| Aug 1 | 6 | 3 | 2 | 1 | 2 | ||||||||||
| Aug 2 | 5 | 2 | 1 | 1 | 1 | 4 | |||||||||
| Nov 1 | 11 | 2 | 1 | ||||||||||||
| Nov 2 | 5 | 2 | 1 | 2 | 1 | ||||||||||
| Feb 1 | 1 | 2 | 7 | 2 | |||||||||||
| Feb 2 | 1 | 6 | 3 | 3 | |||||||||||
| HMA sponge, P. ficiformis | |||||||||||||||
| Aug 1 | 2 | ||||||||||||||
| Aug 2 | 1 | ||||||||||||||
| LMA sponges | |||||||||||||||
| S. cunctatrix | |||||||||||||||
| Aug 1 | 7 | ||||||||||||||
| Aug 2 | 4 | 3 | |||||||||||||
| D. avara | |||||||||||||||
| May 1 | 7 | 9 | |||||||||||||
| May 2 | 3 | 20 | 3 | ||||||||||||
| Aug 1 | 24 | 1 | 6 | ||||||||||||
| Aug 2 | 14 | ||||||||||||||
| Nov 1 | 13 | 1 | 2 | ||||||||||||
| Nov 2 | 6 | 4 | 6 | ||||||||||||
| Feb 1 | 25 | 3 | |||||||||||||
| Feb 2 | 7 | 2 | 4 | ||||||||||||
| A. damicornis | |||||||||||||||
| May 1 | 4 | 1 | 3 | 6 | 7 | 4 | |||||||||
| May 2 | 2 | 3 | 4 | 17 | |||||||||||
| Aug 1 | 2 | 1 | 19 | ||||||||||||
| Aug 2 | 1 | 6 | 14 | 4 | 1 | ||||||||||
| Nov 1 | 2 | 9 | |||||||||||||
| Nov 2 | 17 | 1 | 3 | ||||||||||||
| Feb1 | 15 | ||||||||||||||
| Feb 2 | 9 | 1 | 7 | 4 | 1 | ||||||||||
a
The subclusters are defined in Fig. 4.
b
Duplicates for each sample (indicated by 1 and 2) are shown. HMA, high microbial abundance; LMA, low microbial abundance.