TABLE 4.

Comparison of HLA-DRB1 allele frequencies between RV144 individuals and other populations^a

Allele	G Groupingb	RV144	Northeast Thais (7)	Southern China (Han) (16)	Taiwan (17)	Mongolia (Khalkha) (18)	Vietnam (19)	Japan (20)	South Korea (21)	India (Delhi) (22)	EUR (23)	AFA (23)	API (23)	HIS (23)
		2N=900	2N=800	2N=528	2N=728	2N=200	2N=340	2N=742	2N=970	2N=188	2N=12792	2N=3734	2N=2454	2N=2936
DRB1*01:01	DRB1*01:01:01G	0.003	0.001c	0.004	0.003	0.025		0.065	0.068	0.005	0.091	0.026	0.027	0.039
DRB1*03:01	DRB1*03:01:01G	0.051	0.061	0.066	0.067	0.090	0.047		0.029	0.122	0.129	0.071	0.054	0.073
DRB1*04:03		0.017	0.016	0.044	0.012	0.025	0.021	0.040	0.035	0.047	0.006	0.002	0.035	0.019
DRB1*04:04		0.004	0.003	0.006	0.005		0.003	0.001	0.022	0.026	0.036	0.007	0.009	0.055
DRB1*04:05		0.052	0.059	0.042	0.059	0.050	0.038	0.115	0.092	0.005	0.004	0.010	0.058	0.019
DRB1*04:06	DRB1*04:06:01G	0.010	0.004	0.021	0.029		0.006	0.035	0.041	0.005		0.001	0.021	0.002
DRB1*04:10		0.001		0.002				0.018	0.010			0.001	0.004	0.005
DRB1*04:87		0.001
DRB1*07:01	DRB1*07:01:01G	0.104	0.059c	0.057	0.045	0.120	0.076	0.003	0.072	0.175	0.138	0.098	0.082	0.105
DRB1*08:03/19		0.015	0.014c	0.059	0.098	0.025	0.041	0.081	0.080		0.001		0.052	0.001
DRB1*09:01	DRB1*09:01:02G	0.101	0.071c	0.144	0.194	0.095	0.097	0.124	0.092	0.011	0.008	0.032	0.102	0.010
DRB1*10:01		0.022	0.024	0.011	0.011	0.040	0.056	0.009	0.017	0.048	0.008	0.019	0.031	0.015
DRB1*11:01	DRB1*11:01:01G	0.026	0.026	0.070	0.099	0.065	0.015	0.034	0.044	0.059	0.057	0.087	0.051	0.042
DRB1*11:06	DRB1*11:06:01G	0.018	0.026			0.005			0.001				0.003
DRB1*12:01	DRB1*12:01:01G	0.006		0.028	0.037	0.025	0.009	0.038	0.033	0.005	0.015	0.040	0.029	0.012
DRB1*12:02		0.167	0.134	0.133	0.098	0.045	0.353	0.015	0.033	0.011	0.000	0.003	0.074	0.001
DRB1*13:01	DRB1*13:01:01G	0.003	0.004	0.009	0.001	0.035	0.006	0.007	0.009	0.059	0.063	0.056	0.024	0.042
DRB1*13:02		0.010	0.010	0.028	0.026	0.035	0.018	0.077	0.087	0.059	0.040	0.064	0.036	0.039
DRB1*13:03		0.001	0.019				0.018			0.016	0.010	0.037		0.015
DRB1*13:12		0.011		0.008	0.007								0.004
DRB1*14:01	DRB1*14:01:01G	0.030	0.034	0.017	0.037	0.045	0.032	0.042	0.030	0.027	0.025	0.021	0.024	0.014
DRB1*14:04		0.037	0.028	0.002	0.003		0.018			0.074			0.020
DRB1*14:05		0.008	0.004	0.019	0.008		0.012	0.011	0.035				0.018
DRB1*14:10		0.004							0.002
DRB1*14:18		0.001			0.001								0.001
DRB1*14:22		0.002
DRB1*15:01	DRB1*15:01:01G	0.086	0.078	0.108	0.091	0.060	0.038	0.085	0.074	0.059	0.144	0.029	0.079	0.067
DRB1*15:02		0.144	0.183	0.053	0.023	0.035	0.062	0.100	0.033	0.059	0.008	0.002	0.081	0.013
DRB1*15:03	DRB1*15:03:01G	0.002										0.117	0.001	0.011
DRB1*15:04		0.007											0.001
DRB1*15:06		0.002								0.021			0.004
DRB1*16:02		0.050	0.075	0.053	0.025	0.005	0.018	0.009	0.006	0.011	0.001	0.015	0.020	0.021

AFA, African American; API, Asian American; EUR, European American; HIS, Hispanic American.

^aBold values: Significant at a p-value threshold of 0.05.

^bNomenclature used for alleles that were ambiguous for exon 2 by four-digit HLA typing.

^cReported as two-digit allele.