Table 3.
Phenotypes, antibiotics resistance gene and integrons among MDR Pseudomonas spp
| Source | Strain ID | Bacteria | Phenotype | tet(A) | tet (B) | tet (E) | tet(M) | tet (30) | Sul 1 | Sul 2 | blaSHV | blaCTX | blaTEM | aph (3″)c | ant (3″)b | aph (6)1d d | int 1 | v 1 | int 2 | v 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IRW | 96b | P. putida | FF, T, CEF, SU, AMC | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| IFW | 89 | P. putida | T, S, G, K, C, SXT, AMC, SU | + | − | − | − | + | − | − | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − |
| EDRW | 299A | P. otitidis | FF, C, SXT, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EDRW | 99A | P. putida | FF, SXT, AMC | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EDRW | 299B2 | P. otitidis | FF, CEF, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| EDM1 | 159B | P. fluorescens | T, S, G, N, CEF, SXT | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| EDM1 | 304A | P. otitidis | T, SU, SXT, AMC, S, G, CEF, FF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − | − |
| EDM1 | 306A | P. otitidis | FF, CEF, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EDM1 | 85B | P. putida | SXT, AMC, C, FF | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EDM1 | 106 | P. putida | T, SU, SXT, AMC, S, N | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| AFW | 6B | P. fluorescens | T, S, G, K, CEF, SXT | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| AFW | 6A | P. fluorescens | T, S, G, K, C, CEF, SXT, AMC, SU, FF | + | − | − | − | − | + | − | + | − | + | + | + | − | + | + | − | − |
| OWODFW | 350 | P. otitidis | SXT, SU | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| OWODM1 | 260 | P. putida | FF, T, C, N, CEF, SXT, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − | − |
| OWODM2 | 251B | P. putida | T, S, C, SXT, SU | + | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | − | − |
| OWIRW | 343B | P. otitidis | FF, T, S, N, CEF, AMC, SU | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| OWIRW | 343A | P. otitidis | FF, K, C, SXT, N, CEF, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| OWIRW | 223 | P. otitidis | FF, S, C, CEF, SXT, AMC, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| OWRW | 175B | P. putida | T, S, C, K, CEF, SXT, AMC, SU | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | + | − | + | + | + | − | − |
| OWIRW | 342A | P. otitidis | FF, AMC, CEF, SU | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| OWIM1 | 196 | P. putida | FF, T, S, G, K, AMC, SU | + | − | + | − | − | + | − | − | − | + | + | + | − | + | + | − | − |
| OWIM2 | 244B | P. putida | FF, T, S, G, K, C, SXT, AMC, SU | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | − | − |
| Total | 7 | 0 | 1 | 0 | 1 | 7 | 6 | 5 | 0 | 9 | 8 | 8 | 3 | 6 | ||||||
| Percentages | 31.8 | 0 | 4.6 | 0 | 4.6 | 31.8 | 27.3 | 27.3 | 0 | 40.9 | 36.4 | 36.4 | 13.6 | 27.3 |
Antibiotics code: FF florfenicol, T tetracycline, S streptomycin, G gentamicin, K kanamycin, C chloramphenicol, N nalidixic acid, AMC amoxicillin/clavulanic acid, CEF ceftiofur, SU sulfamethoxazole, SXT sulfamethoxazole/trimethoprim
Source code: IFW Ife treated water, EDM1 Ede municipal Tap 1, AFW Asejire treated water, OWODM2 Owena Ondo Municipal Tap 2, OWIRW Owena-Idanre raw water, OWIM1 Owena-Idanre Municipal Tap 1, OWIM2 Owena-Idanre Municipal Tap 2