Table 2.

Results of allelic association analysis.

SNP	Gene	Control MAF	Vitiligo		Early onset		Late onset		Familial		Sporadic		Extent < 10%		Extent ≥ 10%		Active		Stable
			MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value	MAF	P-value
rs2247421		0.354	0.338	0.6434	0.329	0.6583	0.342	0.7544	0.319	0.56	0.343	0.7765	0.359	0.9097	0.316	0.4009	0.344	0.7934	0.326	0.6039
rs4140967		0.317	0.300	0.6069	0.288	0.5876	0.305	0.7525	0.292	0.6562	0.301	0.6666	0.309	0.8452	0.291	0.5508	0.298	0.6131	0.305	0.8184
rs10776482	TLR10	0.135	0.174	0.1312	0.141	0.8811	0.188	0.0727	0.206	0.1116	0.165	0.2962	0.129	0.8524	0.220	0.0134	0.170	0.2306	0.183	0.2399
rs7694115	TLR10	0.359	0.431	0.0446	0.402	0.4472	0.443	0.0387	0.457	0.1089	0.421	0.1193	0.464	0.0214	0.396	0.4323	0.405	0.2541	0.488	0.0226
rs7660429	TLR10	0.235	0.285	0.1147	0.275	0.4332	0.289	0.1306	0.292	0.2896	0.281	0.1994	0.353	0.0045*	0.216	0.641	0.263	0.4312	0.333	0.0506
rs12233670		0.131	0.153	0.3775	0.100	0.4323	0.175	0.125	0.157	0.5452	0.153	0.4235	0.138	0.8379	0.169	0.2458	0.147	0.5678	0.167	0.3725
rs10005625		0.005	0	0.244	0	0.5252	0	0.3286	0	0.5516	0	0.3188	0	0.4065	0	0.4133	0	0.3311	0	0.5202
rs5743810	TLR6	0.387	0.383	0.9257	0.476	0.1217	0.344	0.2863	0.333	0.3796	0.405	0.6421	0.370	0.7116	0.397	0.8196	0.384	0.9546	0.381	0.9218
rs6531668		0.428	0.427	0.9809	0.549	0.0385	0.375	0.1948	0.347	0.1897	0.460	0.4265	0.420	0.8709	0.434	0.899	0.417	0.7842	0.451	0.6885
rs6531670		0.449	0.419	0.4482	0.348	0.1174	0.451	0.9618	0.538	0.2147	0.380	0.1166	0.436	0.8035	0.400	0.3587	0.410	0.3911	0.439	0.8793
rs1992253		0.038	0.016	0.0885	0.014	0.2821	0.017	0.1609	0.016	0.3606	0.016	0.1387	0.016	0.2234	0.015	0.1974	0.017	0.1797	0.012	0.2442
rs4585282	TLR2	0.008	0.015	0.3593	0.025	0.1572	0.011	0.7506	0.015	0.565	0.015	0.3959	0.021	0.1746	0.008	0.9788	0.005	0.7068	0.036	0.0264
rs7694512	TLR2	0.359	0.369	0.7681	0.300	0.2988	0.399	0.3212	0.343	0.7893	0.378	0.6389	0.400	0.3641	0.336	0.6198	0.326	0.4122	0.464	0.0613
rs13123230	TLR2	0.391	0.379	0.7193	0.325	0.2506	0.401	0.8125	0.357	0.577	0.385	0.8712	0.407	0.7319	0.348	0.3576	0.339	0.1945	0.465	0.1919
rs1339	RNF175	0.262	0.260	0.9675	0.230	0.5552	0.273	0.7578	0.266	0.9433	0.256	0.8729	0.262	0.9927	0.258	0.9422	0.250	0.7609	0.284	0.6815
rs2289318	RNF175	0.253	0.257	0.8998	0.317	0.2166	0.232	0.5493	0.229	0.6516	0.270	0.6439	0.239	0.7319	0.276	0.5837	0.268	0.6762	0.233	0.6782
rs11721827	TLR3	0.199	0.196	0.9199	0.171	0.5626	0.207	0.8189	0.167	0.5294	0.198	0.9713	0.246	0.2359	0.145	0.1635	0.189	0.7641	0.214	0.7625
rs6552950	TLR3	0.266	0.226	0.2106	0.244	0.678	0.218	0.1912	0.271	0.9164	0.206	0.0967	0.217	0.2419	0.234	0.4645	0.225	0.2745	0.226	0.4409
rs4608848		0.371	0.409	0.2841	0.450	0.1705	0.392	0.6016	0.472	0.0942	0.385	0.7209	0.449	0.0875	0.368	0.9431	0.400	0.4701	0.429	0.3068
rs1519309		0.306	0.281	0.4544	0.288	0.7363	0.278	0.4653	0.250	0.3275	0.295	0.7707	0.290	0.7108	0.272	0.4359	0.271	0.3639	0.302	0.946
rs10759932	TLR4	0.196	0.196	0.9954	0.229	0.5192	0.181	0.6712	0.217	0.7025	0.188	0.8277	0.173	0.5674	0.221	0.5543	0.188	0.815	0.214	0.7172
rs5030728	TLR4	0.287	0.222	0.0563	0.203	0.125	0.231	0.1586	0.129	0.0077*	0.256	0.4228	0.277	0.8198	0.169	0.0082*	0.228	0.1355	0.206	0.1556
rs5935436	TLR7	0.079	0.048	0.0977	0.061	0.5662	0.043	0.0881	0.057	0.5162	0.045	0.1103	0.074	0.8313	0.022	0.0192	0.048	0.1487	0.049	0.3313
rs179020	TLR7	0.225	0.361	8.5E-5*	0.226	0.9826	0.416	1.5E-6*	0.293	0.2365	0.378	8.7E-5*	0.366	0.0014	0.356	0.004	0.342	0.0027	0.406	0.0012
rs179013	TLR7	0.243	0.317	0.0208	0.305	0.2214	0.321	0.0291	0.319	0.1548	0.319	0.0326	0.310	0.0979	0.324	0.051	0.328	0.019	0.291	0.3339
rs179008	TLR7	0.258	0.326	0.041	0.325	0.2038	0.326	0.0705	0.309	0.3689	0.330	0.0517	0.329	0.0915	0.323	0.1408	0.341	0.0293	0.293	0.5055
rs10127190	TLR7	0.005	0.004	0.7874	0	0.5252	0.005	0.9723	0	0.5516	0.005	1.0	0.007	0.7518	0	0.4133	0	0.3311	0.012	0.4391
rs850632		0.264	0.264	0.9861	0.305	0.4323	0.247	0.6479	0.292	0.6149	0.248	0.6448	0.271	0.8563	0.257	0.8747	0.255	0.8104	0.286	0.6721
rs179003		0.188	0.215	0.3799	0.243	0.2601	0.202	0.6825	0.219	0.5564	0.216	0.4165	0.189	0.9961	0.242	0.1801	0.235	0.1756	0.167	0.6553

P ≤ 0.05 bolded;

^*P ≤ 0.05 after 10 000 permutations.