Table 3. Cluster-specific markers after prediction analysis-PAM.
Gene | PAM score for cluster 2 | PAM score for cluster 1 | Fold change cluster 2 vs. 1 | Fold change cluster 1 vs. 2 | |
---|---|---|---|---|---|
1 | ZNF331 | -0,1901 | 0,1527 | 0,19 | 5,20 |
2 | HDHD2 | 0,1616 | -0,1298 | 4,45 | 0,22 |
3 | UGDH | 0,0869 | -0,0698 | 3,18 | 0,31 |
4 | TNFRSF17 | 0,0850 | -0,0682 | 3,93 | 0,25 |
5 | FCRLA | 0,0762 | -0,0612 | 4,51 | 0,22 |
6 | C11ORF73 | 0,0709 | -0,0569 | 2,72 | 0,37 |
7 | ZNF559 | 0,0496 | -0,0398 | 3,01 | 0,33 |
8 | ARID5A | -0,0495 | 0,0398 | 0,36 | 2,81 |
9 | TCL1A | 0,0414 | -0,0332 | 4,15 | 0,24 |
10 | SERPINI1 | 0,0413 | -0,0332 | 3,51 | 0,28 |
11 | RP11-35G9.3 | 0,0404 | -0,0325 | 2,84 | 0,35 |
12 | MSH2 | 0,0384 | -0,0309 | 2,86 | 0,35 |
13 | ACADM | 0,0379 | -0,0305 | 3,01 | 0,33 |
14 | FIG4 | 0,0363 | -0,0291 | 2,90 | 0,34 |
15 | C15ORF48 | -0,0294 | 0,0236 | 0,19 | 5,36 |
16 | HIBCH | 0,0228 | -0,0183 | 3,03 | 0,33 |
17 | SLC7A5 | -0,0224 | 0,0180 | 0,28 | 3,60 |
18 | C17ORF62 | 0,0216 | -0,0173 | 2,87 | 0,35 |
19 | RNASEH2A | 0,0173 | -0,0139 | 2,41 | 0,42 |
20 | ELL2 | -0,0166 | 0,0134 | 0,38 | 2,60 |
21 | ATG4C | 0,0141 | -0,0114 | 3,02 | 0,33 |
22 | SAMD9L | 0,0128 | -0,0103 | 2,91 | 0,34 |
23 | GOLPH3L | 0,0104 | -0,0084 | 2,62 | 0,38 |
24 | STX7 | 0,0094 | -0,0076 | 2,59 | 0,39 |
25 | MTMR6 | -0,0089 | 0,0072 | 0,39 | 2,57 |
26 | HDDC3 | 0,0083 | -0,0067 | 2,35 | 0,43 |
27 | ZDHHC16 | 0,0077 | -0,0062 | 2,58 | 0,39 |
28 | TBCK | 0,0062 | -0,0050 | 2,73 | 0,37 |
29 | CYB561A3 | 0,0060 | -0,0049 | 2,45 | 0,41 |
30 | CHD1 | -0,0051 | 0,0041 | 0,44 | 2,28 |
31 | AIM2 | 0,0044 | -0,0035 | 3,15 | 0,32 |
32 | ACOT13 | 0,0023 | -0,0018 | 2,45 | 0,41 |
33 | ACYP1 | 0,0011 | -0,0009 | 2,76 | 0,36 |
34 | FCGR2B | 0,0011 | -0,0008 | 2,88 | 0,35 |
Fold change from SAM