Table 1.
Target RNA | Forward primer | Reverse primer | Amplicon (bp) |
---|---|---|---|
HIV-1 gRNA | 5′-TGTGTGCCCGTCTGTTGTGT-3′ | 5′-GAGTCCTGCGTCGAGAGAGC-3′ | 143 |
HIV-1 Tat 1-86 | 5′-GGAAGCATCCAGGAAGTCAGCCTA-3' | 5′-GGGTTGGGAGGTGGGTTGCTT-3' | 170 |
7SL | 5′-ATCGGGTGTCCGCACTAAG-3′ | 5′-CACCCCTCCTTAGGCAACCT-3′ | 81 |
Y4 | 5′-AAGCCAGTCAAATTTAGCAGTGGG-3′ | 5′-AAGCCAGTCAAATTTAGCAGTGGG-3′ | 93 |
Y1 | 5′-GGCTGGTCCGAAGGTAGTGA-3′ | 5′-AAAAGACTAGTCAAGTGCAGT-3′ | 113 |
GAPDH | 5′-CATGGCACCGTCAAGGCTGAGAA-3′ | 5′-CAGTGGACTCCACGACGTACTCA-3' | 130 |
β-Actin | 5′-CTGGCACCACACCTTCTACAATGA-3′ | 5′-GCTGGGGTGTTGAAGGTCTCAAA-3′ | 137 |
EEF2 | 5′-ATCCGCGCCATCATGGACAAGAA-3' | 5′-TCGTCCTTCCGGGTATCAGTGAA-3' | 164 |
EndoG | 5′-AGGCCATGGACGACACGTTCTAC-3′ | 5'-GAAGAGTGGCCCTGTGCAGACATA-3' | 146 |
CPSF100 | 5′-GCCATCAGCTCATAAGACGAAGCAT-3′ | 5′-AGTAGC TTGAAGCTCTGGCACTAAG-3' | 187 |
aHIV-1 Tat1-86 (full-length) | 5′-ATGGAGCCAGTAGATCCTAGA-3′ | 5′-CTATTCCTTCGGGCCTGTC-3′ | 261 |
amEndoG | 5′-CACCATGGACGACACCTTCTACC-3′ | 5′-CTTGCTGCCAGCAGTGATAGC-3′ | 432 |
(C-terminal) |
Primers for cDNA cloning.