Table 2. Positive selection in 41 cetacean TAG metabolism-related genes based on the analysis of the cetacean-only dataset by PAML, DATAMONKEY, or TreeSAAP.
Gene | PAML* | DATAMONKEY* | TreeSAAP* |
---|---|---|---|
ACACA | Y | N | Y |
ACSL1 | Y | Y | Y |
ACSL5 | Y | Y | Y |
ACSL6 | Y | Y | Y |
ACSS1 | Y | Y | Y |
AGPAT5 | Y | Y | N |
AGPAT6 | Y | Y | Y |
APOB | Y | N | Y |
CD36 | Y | Y | Y |
CIDEA | Y | N | Y |
DGAT1 | Y | Y | Y |
DGAT2 | Y | N | Y |
DGKA | Y | Y | Y |
DGKG | Y | N | Y |
DGKH | Y | N | Y |
DGKQ | Y | Y | Y |
FABP2 | Y | N | Y |
FABP4 | Y | Y | Y |
FATP2 | Y | Y | Y |
FATP3 | Y | N | Y |
GNPAT | Y | Y | Y |
GOT2 | Y | Y | Y |
GPAT2 | Y | Y | Y |
LXRb | Y | N | Y |
MGLL | Y | N | Y |
MOGAT1 | Y | Y | Y |
MOGAT2 | Y | Y | Y |
PDE3B | Y | Y | Y |
PLCB2 | Y | Y | Y |
PLCB4 | Y | N | Y |
PLCD3 | Y | N | Y |
PLCD4 | Y | Y | Y |
PLCE1 | Y | Y | N |
PLCG2 | Y | N | Y |
PLCH1 | Y | N | Y |
PLCH2 | Y | Y | Y |
PLCZ1 | Y | Y | Y |
PLIN1 | Y | Y | Y |
PNLIP | Y | Y | Y |
PPAP2C | Y | Y | Y |
SREBF2 | Y | N | Y |
Note: Y, positive selection was detected; N, no positive selection was detected.
*Results are listed in Supplementary Tables S4,5,6.