Table I.

Overview of the institute-specific gene panels.

Chromosome	From (hg19)	To (hg19)	Gene name	Exon
Custom panel Heidelberg
chr1	27056234	27056365	ARID1A	2
chr1	27057662	27057775	ARID1A	3
chr1	27057875	27058001	ARID1A	3
chr1	27092899	27093023	ARID1A	10
chr1	27094337	27094460	ARID1A	11
chr1	27099336	27099464	ARID1A	14
chr1	27100275	27100411	ARID1A	17
chr1	27105906	27106030	ARID1A	20
chr1	27106449	27106570	ARID1A	20
chr1	27106750	27106883	ARID1A	20
chr1	115256484	115256587	NRAS	3
chr1	115258676	115258805	NRAS	2
chr1	150549826	150549952	MCL-1	3
chr1	150551531	150551670	MCL-1	1
chr2	178098765	178098890	NFE2L2	2
chr3	41266029	41266147	CTNNB1	3
chr3	41266893	41267010	CTNNB1	5
chr3	41275089	41275211	CTNNB1	9
chr3	178916892	178917000	PIK3CA	2
chr3	178921523	178921633	PIK3CA	5
chr3	178928050	178928160	PIK3CA	8
chr3	178936022	178936106	PIK3CA	10
chr3	178938830	178938960	PIK3CA	14
chr3	178952038	178952157	PIK3CA	21
chr3	181430178	181430283	SOX2	1
chr3	181430516	181430649	SOX2	1
chr4	1803550	1803636	FGFR3	7
chr4	1808277	1808409	FGFR3	16
chr4	55131108	55131222	PDGFRA	5
chr4	55139749	55139881	PDGFRA	10
chr4	55140692	55140818	PDGFRA	11
chr4	55141036	55141156	PDGFRA	12
chr4	55152001	55152128	PDGFRA	18
chr4	55156632	55156764	PDGFRA	22
chr4	55592107	55592203	KIT	9
chr4	55593595	55593684	KIT	11
chr4	153245407	153245522	FBXW7	11
chr4	153247237	153247369	FBXW7	10
chr4	153249405	153249530	FBXW7	9
chr5	1264501	1264634	TERT	11
chr5	1293392	1293528	TERT	2
chr6	66115100	66115214	EYS	7
chr6	66204680	66204810	EYS	5
chr7	55241602	55241732	EGFR	18
chr7	55242411	55242544	EGFR	19
chr7	55248974	55249100	EGFR	20
chr7	55259416	55259546	EGFR	21
chr7	92300724	92300853	CDK6	5
chr7	92403995	92404124	CDK6	3
chr7	116411944	116412066	MET	14
chr7	116417426	116417508	MET	16
chr7	140453110	140453232	BRAF	15
chr7	140481387	140481511	BRAF	11
chr8	38275705	38275835	FGFR1	10
chr8	38282107	38282241	FGFR1	7
chr8	128751156	128751293	MYC	2
chr8	128752956	128753086	MYC	3
chr9	5069993	5070100	JAK2	12
chr9	5073678	5073788	JAK2	14
chr9	5126715	5126797	JAK2	25
chr9	21970912	21971032	CDKNA2	2
chr9	21971086	21971218	CDKNA2	2
chr9	21974672	21974792	CDKNA2	1
chr9	139401722	139401834	NOTCH1	22
chr9	139404170	139404306	NOTCH1	18
chr9	139412260	139412400	NOTCH1	8
chr9	139413034	139413159	NOTCH1	6
chr10	89624207	89624322	PTEN	1
chr10	89685258	89685374	PTEN	3
chr10	89692864	89692987	PTEN	5
chr10	89711806	89711936	PTEN	6
chr10	89717622	89717747	PTEN	7
chr10	89720778	89720902	PTEN	8
chr10	123256020	123256129	FGFR2	13
chr10	123279495	123279622	FGFR2	7
chr11	533800	533929	HRAS	3
chr11	534220	534349	HRAS	2
chr11	69456096	69456216	CCND1	1
chr11	69458624	69458747	CCND1	3
chr11	119103162	119103275	CBL	2
chr11	119148912	119149006	CBL	8
chr11	119149215	119149290	CBL	9
chr12	25380249	25380348	KRAS	3
chr12	25398183	25398310	KRAS	2
chr12	69210596	69210679	MDM2	4
chr12	69233038	69233165	MDM2	11
chr13	48881433	48881526	RB1	2
chr13	48916793	48916902	RB1	3
chr13	48923124	48923208	RB1	6
chr13	48951050	48951160	RB1	13
chr13	48954320	48954437	RB1	16
chr13	48955427	48955539	RB1	17
chr13	49027105	49027191	RB1	18
chr13	49033834	49033935	RB1	20
chr13	49037844	49037955	RB1	21
chr13	49039144	49039221	RB1	22
chr13	49039304	49039410	RB1	23
chr14	36987081	36987213	NKX-2.1	2
chr14	36988227	36988351	NKX-2.1	1
chr14	105246470	105246589	AKT1	3
chr17	7573886	7574019	TP53	10
chr17	7576836	7576950	TP53	9
chr17	7577028	7577157	TP53	8
chr17	7577492	7577629	TP53	7
chr17	7578180	7578289	TP53	6
chr17	7578425	7578555	TP53	5
chr17	7579278	7579397	TP53	4
chr17	7579454	7579566	TP53	4
chr17	37880169	37880287	ERBB2	19
chr17	37880958	37881089	ERBB2	20
chr18	48581196	48581323	SMAD4	5
chr18	48584702	48584826	SMAD4	7
chr18	48591813	48591934	SMAD4	9
chr18	48604680	48604811	SMAD4	12
chr19	1206977	1207113	STK11	1
chr19	1218379	1218488	STK11	2
chr19	1220390	1220504	STK11	4
chr19	1220594	1220684	STK11	5
chr19	1221205	1221340	STK11	6
chr19	1223020	1223155	STK11	8
chr19	10599879	10600011	KEAP1	5
chr19	10600372	10600496	KEAP1	4
chr19	10602263	10602390	KEAP1	3
chr19	10602579	10602708	KEAP1	3
chr19	10602796	10602912	KEAP1	3
chr19	10610088	10610218	KEAP1	2
chr19	10610289	10610416	KEAP1	2
chr19	10610465	10610599	KEAP1	2
chr19	11094812	11094945	SMARCA4	2
chr19	11136088	11136220	SMARCA4	22
chr19	11138426	11138556	SMARCA4	23
chr19	11141448	11141561	SMARCA4	25
chr19	11144042	11144179	SMARCA4	26
chr19	30308024	30308156	CCNE1	5
chr19	30313134	30313262	CCNE1	10
chrX	47028755	47028888	RBM10	3
chrX	47034396	47034523	RBM10	5
chrX	63411268	63411399	FAM123B/AMER1	1
chrX	63412836	63412964	FAM123B/AMER1	1
Custom panel Cologne
chr1	115256352	115256453	NRAS	3
chr1	115256453	115256550	NRAS	3
chr1	115256550	115256672	NRAS	3
chr1	115258676	115258798	NRAS	2
chr1	162688829	162688951	DDR2	3
chr1	162722872	162722995	DDR2	4
chr1	162724359	162724466	DDR2	5
chr1	162724466	162724586	DDR2	5
chr1	162724586	162724687	DDR2	5
chr1	162724850	162724967	DDR2	6
chr1	162724967	162725094	DDR2	6
chr1	162725447	162725572	DDR2	7
chr1	162729566	162729694	DDR2	8
chr1	162729681	162729782	DDR2	8
chr1	162730973	162731107	DDR2	9
chr1	162731107	162731197	DDR2	9
chr1	162731197	162731276	DDR2	9
chr1	162735765	162735879	DDR2	10
chr1	162736904	162737029	DDR2	11
chr1	162737029	162737154	DDR2	11
chr1	162740090	162740201	DDR2	12
chr1	162740201	162740327	DDR2	12
chr1	162741756	162741887	DDR2	13
chr1	162741887	162742002	DDR2	13
chr1	162742002	162742088	DDR2	13
chr1	162743204	162743301	DDR2	14
chr1	162743301	162743421	DDR2	14
chr1	162745384	162745513	DDR2	15
chr1	162745513	162745634	DDR2	15
chr1	162745915	162746038	DDR2	16
chr1	162746038	162746162	DDR2	16
chr1	162748317	162748432	DDR2	17
chr1	162748432	162748519	DDR2	17
chr1	162749866	162749977	DDR2	18
chr1	162749977	162750066	DDR2	18
chr2	29432650	29432776	ALK	25
chr2	29436843	29436974	ALK	24
chr2	29443565	29443688	ALK	23
chr2	29443688	29443772	ALK	23
chr2	29445200	29445332	ALK	22
chr2	29445369	29445489	ALK	21
chr3	41266072	41266193	CTNNB1	3
chr3	178935940	178936023	PIK3CA	9
chr3	178936023	178936105	PIK3CA	9
chr3	178936092	178936180	PIK3CA	9
chr3	178951824	178951942	PIK3CA	20
chr3	178951942	178952063	PIK3CA	20
chr3	178952063	178952155	PIK3CA	20
chr7	55241596	55241679	EGFR	18
chr7	55241679	55241800	EGFR	18
chr7	55242411	55242539	EGFR	19
chr7	55248984	55249117	EGFR	20
chr7	55249117	55249200	EGFR	20
chr7	55259367	55259486	EGFR	21
chr7	55259484	55259567	EGFR	21
chr7	116411701	116411801	cMET	intron 13/14
chr7	116411801	116411909	cMET	14
chr7	116411894	116411998	cMET	intron 13/14
chr7	116411998	116412072	cMET	14
chr7	140453023	140453099	BRAF	15
chr7	140453099	140453224	BRAF	15
chr7	140481297	140481387	BRAF	11
chr7	140481387	140481511	BRAF	11
chr10	89624207	89624322	PTEN	1
chr10	89653745	89653817	PTEN	2
chr10	89653816	89653930	PTEN	2
chr10	89685258	89685374	PTEN	3
chr10	89690819	89690917	PTEN	4
chr10	89692713	89692819	PTEN	5
chr10	89692819	89692920	PTEN	5
chr10	89692920	89693032	PTEN	5
chr10	89711802	89711928	PTEN	6
chr10	89711917	89712018	PTEN	6
chr10	89717580	89717695	PTEN	7
chr10	89717694	89717792	PTEN	7
chr10	89720692	89720768	PTEN	8
chr10	89720769	89720842	PTEN	8
chr10	89724948	89725061	PTEN	9
chr10	89725058	89725147	PTEN	9
chr10	89725207	89725320	PTEN	9
chr12	25380167	25380240	KRAS	3
chr12	25380240	25380357	KRAS	3
chr12	25398183	25398304	KRAS	2
chr12	25398304	25398379	KRAS	2
chr14	105246406	105246502	AKT1	4
chr14	105246500	105246583	AKT1	4
chr15	66727356	66727487	MAP2K1	2
chr15	66727487	66727602	MAP2K1	2
chr17	7577017	7577142	TP53	8
chr17	7577140	7577233	TP53	8
chr17	7577392	7577509	TP53	7
chr17	7577508	7577611	TP53	7
chr17	7578141	7578234	TP53	6
chr17	7578234	7578362	TP53	6
chr17	7578310	7578425	TP53	5
chr17	7578425	7578555	TP53	5
chr17	7579278	7579385	TP53	4
chr17	7579385	7579502	TP53	4
chr17	7579502	7579590	TP53	4
chr17	37880155	37880283	HER2	19
chr17	37880960	37881074	HER2	20
chr17	37881074	37881206	HER2	20