Skip to main content
. 2015 Oct 16;15:215. doi: 10.1186/s12866-015-0557-7

Table 4.

Relative abundance of OTUs recovered from synthetic communities spiked into whole blood

OTU taxonomic ID SC1 SC1 Sap SC1 1Wash SC1 Full SC3 SC3 Sap SC3 1Wash SC3 Full SC5 SC5 Sap SC5 1Wash SC5 Full
Enterobacteriaceae (E. hormaechei) 32.22 % 43.58 % 54.37 % 54.78 % 36.15 % 29.76 % 39.65 % 37.26 % 24.60 % 37.40 % 1.94 % 53.01 %
Staphylococcus (S. aureus, S. epidermidis) 35.59 % 26.11 % 9.76 % 9.40 % 40.03 % 42.14 % 19.45 % 16.69 % 13.03 % 36.95 % 94.93 % 6.54 %
Escherichia (E. coli) 10.82 % 0.01 % 0.33 % 0.26 % 0.90 % 5.36 % 7.56 % 13.30 % 19.67 % 0.03 % 0.70 % 1.00 %
Streptococcus (S. pneumoniae, S. intermedius) 0.30 % 2.98 % 0.17 % 0.24 % 0.00 % 2.56 % 0.80 % 2.08 % 2.72 % 1.27 % 0.16 % 0.19 %
Neisseria (N. flava) 0.13 % 0.00 % 0.06 % 0.10 % 0.00 % 0.24 % 1.20 % 0.36 % 1.83 % 0.00 % 0.03 % 0.01 %
Actinomycetales (M. luteus) 0.01 % 0.01 % 0.02 % 0.12 % 0.00 % 0.55 % 0.28 % 1.09 % 0.95 % 0.00 % 0.12 % 0.07 %
Fusobacterium (F. necrophorum) 0.12 % 0.00 % 0.05 % 0.13 % 0.00 % 0.29 % 0.75 % 0.40 % 0.40 % 0.00 % 0.02 % 0.00 %
Prevotella (P. melaninogenica) 0.25 % 0.00 % 0.01 % 0.14 % 0.00 % 0.02 % 0.33 % 0.44 % 0.31 % 0.01 % 0.01 % 0.02 %
Other OTUs 20.56 % 27.32 % 35.23 % 34.84 % 22.90 % 19.08 % 29.98 % 28.39 % 36.47 % 24.34 % 2.09 % 39.15 %