Table 4.
OTU taxonomic ID | SC1 | SC1 Sap | SC1 1Wash | SC1 Full | SC3 | SC3 Sap | SC3 1Wash | SC3 Full | SC5 | SC5 Sap | SC5 1Wash | SC5 Full |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Enterobacteriaceae (E. hormaechei) | 32.22 % | 43.58 % | 54.37 % | 54.78 % | 36.15 % | 29.76 % | 39.65 % | 37.26 % | 24.60 % | 37.40 % | 1.94 % | 53.01 % |
Staphylococcus (S. aureus, S. epidermidis) | 35.59 % | 26.11 % | 9.76 % | 9.40 % | 40.03 % | 42.14 % | 19.45 % | 16.69 % | 13.03 % | 36.95 % | 94.93 % | 6.54 % |
Escherichia (E. coli) | 10.82 % | 0.01 % | 0.33 % | 0.26 % | 0.90 % | 5.36 % | 7.56 % | 13.30 % | 19.67 % | 0.03 % | 0.70 % | 1.00 % |
Streptococcus (S. pneumoniae, S. intermedius) | 0.30 % | 2.98 % | 0.17 % | 0.24 % | 0.00 % | 2.56 % | 0.80 % | 2.08 % | 2.72 % | 1.27 % | 0.16 % | 0.19 % |
Neisseria (N. flava) | 0.13 % | 0.00 % | 0.06 % | 0.10 % | 0.00 % | 0.24 % | 1.20 % | 0.36 % | 1.83 % | 0.00 % | 0.03 % | 0.01 % |
Actinomycetales (M. luteus) | 0.01 % | 0.01 % | 0.02 % | 0.12 % | 0.00 % | 0.55 % | 0.28 % | 1.09 % | 0.95 % | 0.00 % | 0.12 % | 0.07 % |
Fusobacterium (F. necrophorum) | 0.12 % | 0.00 % | 0.05 % | 0.13 % | 0.00 % | 0.29 % | 0.75 % | 0.40 % | 0.40 % | 0.00 % | 0.02 % | 0.00 % |
Prevotella (P. melaninogenica) | 0.25 % | 0.00 % | 0.01 % | 0.14 % | 0.00 % | 0.02 % | 0.33 % | 0.44 % | 0.31 % | 0.01 % | 0.01 % | 0.02 % |
Other OTUs | 20.56 % | 27.32 % | 35.23 % | 34.84 % | 22.90 % | 19.08 % | 29.98 % | 28.39 % | 36.47 % | 24.34 % | 2.09 % | 39.15 % |