TABLE 4.
Within-country evolutionary rates of influenza A virus HA genes among 14 high-priority subtypes over 12 years (2000 to 2011)
World region | Country | Within-country evolutionary rate (no. of nucleotide substitutions/site/yr × 10−3) of influenza A virus HA genea |
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H1N2 | H3N2 | H3N6 | H3N8-eq | H3N8-av | H4N6 | H5N1 | H5N2 | H5N3 | H6N1 | H6N2 | H6N8 | H7N3 | H7N7 | H9N2 | ||
East Asia | China | 3.54 | 3.53 | 1.43 | 3.91 | 8.88 | 4.22 | 4.57 | 4.37 | 3.13 | ||||||
Hong Kong | 3.69 | 6.24 | 4.42 | 10.3 | 5.16 | |||||||||||
Japan | 4.79 | 3.55 | 5.32 | 3.69 | 3.84 | 7.51 | 6.21 | 3.51 | 9.98 | |||||||
Mongolia | 8.22 | |||||||||||||||
South Korea | 3.75 | 3.41 | 5.03 | 1.68 | 3.12 | 10.34 | 7.05 | 6.32 | 6.89 | |||||||
Taiwan | 4.81 | 4.72 | 7.81 | 4.64 | ||||||||||||
Southeast Asia | Cambodia | 7.71 | 6.71 | |||||||||||||
Laos | 4.85 | |||||||||||||||
Myanmar | 8.89 | |||||||||||||||
Indonesia | 4.06 | |||||||||||||||
Thailand | 3.31 | 2.32 | ||||||||||||||
Vietnam | 4.71 | 4.39 | ||||||||||||||
South Asia | Bangladesh | 7.71 | 6.49 | |||||||||||||
India | 4.18 | 8.82 | 5.86 | |||||||||||||
Pakistan | 1.53 | 7.85 | 5.89 | |||||||||||||
Iran | 7.31 | 2.95 | ||||||||||||||
West Asia | Israel | 5.47 | 4.34 | |||||||||||||
Saudi Arabia | 9.01 | |||||||||||||||
Turkey | 3.03 | |||||||||||||||
UAE | 8.78 | |||||||||||||||
Africa | Egypt | 6.51 | 4.22 | |||||||||||||
Nigeria | 5.48 | |||||||||||||||
South Africa | 7.95 | |||||||||||||||
Europe | France | 6.32 | 3.38 | |||||||||||||
Germany | 5.81 | |||||||||||||||
Italy | 6.21 | 3.44 | 4.98 | |||||||||||||
Romania | 8.86 | |||||||||||||||
Russia | 6.22 | 4.59 | 5.99 | |||||||||||||
Sweden | 6.74 | 10.49 | ||||||||||||||
United Kingdom | 4.15 | 4.59 | 2.46 | |||||||||||||
North America | Canada | 2.84 | 2.49 | 3.66 | 3.01 | 5.84 | ||||||||||
United States | 3.35 | 3.45 | 2.42 | 2.92 | 2.43 | 2.99 | 2.26 | 2.38 | 6.12 | 5.58 | 2.04 | 3.23 | 5.16 | 11.62 | 6.51 |
Boldface indicates significantly higher substitution rates.