Table 3. List of identified simple sequence repeats of the Dianthus chloroplast genome.
SSR sequence | Number of repeats | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | Total | |
A/T | - | 101 | 40 | 30 | 8 | 7 | 6 | 2 | 4 | 1 | 2 | 1 | 1 | 203 | ||||
G/C | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||
AC/GT | 43 | 2 | 45 | |||||||||||||||
AG/CT | 101 | 10 | 111 | |||||||||||||||
AT/AT | 162 | 37 | 7 | 1 | 2 | 209 | ||||||||||||
CG/CG | 10 | 10 | ||||||||||||||||
AAC/GTT | 9 | 9 | ||||||||||||||||
AAG/CTT | 18 | 18 | ||||||||||||||||
AAT/ATT | 25 | 6 | 2 | 1 | 34 | |||||||||||||
ACC/GGT | 4 | 4 | ||||||||||||||||
ACT/AGT | 2 | 2 | ||||||||||||||||
AGC/GCT | 5 | 5 | ||||||||||||||||
AGG/CCT | 3 | 3 | ||||||||||||||||
ATC/GAT | 2 | 2 | ||||||||||||||||
AAAC/GTTT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
AAAG/CTTT | 2 | 2 | ||||||||||||||||
AAAT/ATTT | 3 | 1 | 4 | |||||||||||||||
AAGG/CCTT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
AATC/GATT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
AATT/AATT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
ACCT/AGGT | 2 | 2 | ||||||||||||||||
AATAC/GTATT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
AATGGG/CCCATT | 1 | 1 | ||||||||||||||||
Total | 672 |