Table 1.
Sources of pathogens used and GeXP assay results
| Pathogen/field samples | Number of samples | Source | Results | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AIV- M |
AIV- H5 |
AIV- H7 |
AIV- H9 |
DHV | DEV | DTMUV | NDV | EDSV | MDRV | MDPV | DuCV | |||
| Reference sample | ||||||||||||||
| acDNA of H5N3 AIV Duck/HK 313/78 | 1 | HKU | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| aH7N2 AIV Duck/HK/ 47/76 | 1 | HKU | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| aH9N6 AIV Duck/HK/147/77 | 1 | HKU | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| bDHV (AV2111) | 1 | CIVDC | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| cDEV (AV1221) | 1 | CIVDC | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| dDTMUV (GX201301,GX201302) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| eNDV (GX1/00,GX6/02) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
| fEDSV (GEV) | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| gMDRV (NM1,NM2) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| hMDPV (GX-5,GX-6) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | |
| iDuCV (GX1006,GX1008) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |
| Other pathogens | ||||||||||||||
| H1N3 AIVDuck/HK/717/79-d1 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H1N1 AIV Human/NJ/8/76 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H2N3 AIV Duck/HK/77/76 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H3N6 AIV Duck/HK/526/79/2B | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H4N5 AIV Duck/HK/668/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H6N8 AIV Duck/HK/531/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H8N4AIV Turkey/ont/6118/68 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H10N3 AIV Duck/HK/876/80 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H11N3 AIV Duck/HK/661/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H12N5 AIV Duck/HK/862/80 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| H6N8 AIV Duck/HK/531/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| duck Escherichia coli | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| duck Salmonella | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| duck Staphylococcus aureus | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Pasteurella multocida | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Infectious bronchitis virus | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Mycoplasma gallisepticum | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Sample mixture | ||||||||||||||
| AIV-H5 + AIV−H7 + AIV−H9 | 1 | GVRI | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| AIV−H5 + DEV + DTMUV + NDV + EDSV | 1 | GVRI | + | + | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − |
| AIV−H5 + AIV−H7 + AIV−H9 + DHV + DEV + DTMUV + NDV + EDSV+ MDRV+ MDPV+ DuCV | 1 | GVRI | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
HVRI Harbin Veterinary Research Institute, China, HKU The University of HongKong, China, GVRI Guangxi Veterinary Research Institute, China, CIVDC China Institute of Veterinary Drug Control, China, PU University of Pennsylvania
aReferences [23]
bGenBank accession no. : EF442073.1
cGenBank accession no. : EU315247
dGenBank accession no. : KJ700462.1
eGenBank accession no. : JX193083.1
fReferences [35]
gReferences [35]
hGenBank accession no. : KM093740.1
iGenBank accession no. : JX241046.1