Table 1.
Distribution and frequency of ndhF-rpl32 haplotypes
| Shared haplotypes | Region-specific haplotypes [haplotype (N)] | Unique haplotypes | N | n | ||||||||||||
| Range and region | 1 | 5 | 12 | 16 | 17 | 20 | 21 | 28 | 29 | 34 | 35 | 39 | ||||
| Taiwan | 43 | 12 | 8 | 39 | 8 | N = 62, n = 5 | 2, 4, 7, 8, 10, 11, 15, 18, 19 | 181 | 19 | |||||||
| N Taiwan | 35 | 1 | 2, 4 | 38 | 4 | |||||||||||
| C to SE Taiwan | 4 | 7 | 17 | 7 | 3 (2), 9 (44), 13 (5), 14 (4) | 10, 11, 15, 18, 19 | 95 | 13 | ||||||||
| E Taiwan | 4 | 11 | 1 | 22 | 1 | 6 (7) | 7, 8 | 48 | 8 | |||||||
| China | 26 | 44 | 66 | 1 | 6 | 18 | 18 | 5 | N = 57, n = 12 | 26, 30, 31, 38, 44, 45, 47 | 248 | 27 | ||||
| N China | 1 | 40 (6) | 44, 47 | 9 | 4 | |||||||||||
| C China | 4 | 4 | 38 | 9 | 3 | |||||||||||
| Fujian (FJ) | 9 | 5 | 1 | 1 | 22 (5), 23 (3), 46 (7), 48 (4) | 45 | 36 | 9 | ||||||||
| Guangdong (GD) | 13 | 27 | 52 | 1 | 5 | 24 (5), 25 (4), 27 (11) | 26, 30, 31 | 121 | 11 | |||||||
| Guangxi (GX) | 4 | 2 | 3 | 5 | 32 (2) | 16 | 5 | |||||||||
| Yunnan (YN) | 8 | 6 | 15 | 18 | 33 (5), 36 (3), 37 (2) | 57 | 7 | |||||||||
| Indochina | 19 | 7 | 18 | 3 | 1 | 48 | 5 | |||||||||
| N Vietnam (NV) | 7 | 7 | 16 | 3 | 1 | 34 | 5 | |||||||||
| S Vietnam (SV) | 8 | 2 | 10 | 2 | ||||||||||||
| Cambodia (CB) | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||
| Thailand (TH) | 3 | 3 | 1 | |||||||||||||
| Japan | 21 | 2 | 42 | 24 | 3 | |||||||||||
| Tokyo (TK) | 2 | 42 | 3 | 2 | ||||||||||||
| Ryukyus (RK) | 21 | 21 | 1 | |||||||||||||
| Philippines | 2 | 1 | N = 5, n = 1; 43 (5) | 8 | 3 | |||||||||||
| Near Oceania | 17 | 2 | 2 | 21 | 3 | |||||||||||
| Sulawesi | 16 | 16 | 1 | |||||||||||||
| New Guinea | 1 | 2 | 3 | 2 | ||||||||||||
| Solomon Islands | 2 | 2 | 1 | |||||||||||||
| Remote Oceania | 52 | 1 | N = 21, n = 1 | 74 | 3 | |||||||||||
| Fiji | 2 | 2 | 1 | |||||||||||||
| Tonga | 5 | 5 | 1 | |||||||||||||
| Samoa | 2 | 2 | 1 | |||||||||||||
| Niue | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||
| Hawaii | 34 | 1 | 41 (21) | 56 | 3 | |||||||||||
| Austral Islands | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||
| Marquesas | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||
| Pitcairn | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||
| Rapa Nui | 5 | 5 | 1 | |||||||||||||
| Total | 69 | 33 | 8 | 39 | 77 | 66 | 76 | 3 | 6 | 38 | 21 | 6 | N = 145, n = 19 | n = 17 | 604 | 48 |
N, sample size; n, number of haplotypes. Definition of regions (see Fig. 1 for abbreviations): N Taiwan, NW and NE; C to SE Taiwan, CW, PH, SW, SE, GI, and LY; E Taiwan, EN and ES; N China, JL, BJ, SD, SX, HN, and GS; C China, SH, SC, and ZJ; Guangdong (GD), GD and HA; N Vietnam, NV and CV.