Table 2.

Levels of LD for different distance categories between SNP pairs for the different autosomes

Chr	NSNP	0.5 Mb	1.0 Mb	5.0 Mb	10.0 Mb	50.0 Mb
SSC1	3953	0.24	0.21	0.13	0.10	0.06
SSC2	2462	0.42	0.37	0.24	0.18	0.09
SSC3	1868	0.46	0.41	0.28	0.22	0.11
SSC4	2337	0.49	0.44	0.28	0.20	0.07
SSC5	1567	0.40	0.36	0.22	0.16	0.07
SSC6	2352	0.48	0.42	0.28	0.21	0.08
SSC7	2295	0.38	0.33	0.21	0.16	0.07
SSC8	2064	0.50	0.45	0.28	0.21	0.11
SSC9	2308	0.41	0.37	0.24	0.18	0.08
SSC10	1217	0.32	0.28	0.17	0.12	0.05
SSC11	1410	0.37	0.31	0.19	0.14	0.06
SSC12	1022	0.38	0.33	0.18	0.13	0.06
SSC13	2802	0.52	0.47	0.31	0.25	0.16
SSC14	2530	0.47	0.42	0.28	0.21	0.10
SSC15	2099	0.44	0.40	0.26	0.20	0.10
SSC16	1134	0.42	0.36	0.22	0.18	0.08
SSC17	1054	0.47	0.41	0.26	0.20	0.09
SSC18	1045	0.39	0.34	0.20	0.14	0.06
Average		0.42	0.37	0.24	0.18	0.08

Chr chromosome

N _SNP number of SNPs