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. 2015 Nov 17;16:107. doi: 10.1186/s12881-015-0248-0

Table 3.

Primer sequences for the miRNA SNPs included in genotyping study using multiplex PCR reaction and MALDI-TOF MS

SNP Forward primer sequence Reverse primer sequence iPLEX® (Extension) primer sequence
rs2829801 ACGTTGGATGTTCCCACTCAGGCATATAGC ACGTTGGATGTGGAGTCTATGTCCACTTCC TGGGCTAAGCAACCA
rs7395206 ACGTTGGATGTCGGACGCCCAAGTTGGAG ACGTTGGATGTCACACGCACAGTGGGTCT GGTGGGCGGGCGGAG
rs73798217 ACGTTGGATGACTGGAGGTTATCAGAGAGG ACGTTGGATGATGTGTATTCCCCAGTCTCC ACCATTCAGTTCCTAGC
rs353291 ACGTTGGATGGTAGAGATGCCACAAGAGGG ACGTTGGATGAAACCTTAAGTCTTCGTTCG GGTTGTTCTCTGGCTGC
rs55945735 ACGTTGGATGGGTCTCAAACTCCTGACTTC ACGTTGGATGCTGCATCTGAGCACTTCAAG TGATGCCTGGCGGGGCG
rs10902173 ACGTTGGATGTCACAGGCACCTTTTCTCAG ACGTTGGATGGAAGCCTGGGTATTAGGATG ACCTTTTCTCAGCATCTG
rs112394324 ACGTTGGATGACTGGAGAGAGAAATTACCC ACGTTGGATGGTTGAAACCAGAGTACATGC CAGATACGACAGAGTGTG
rs1292037 ACGTTGGATGTACAGCTAGAAAAGTCCCTG ACGTTGGATGGGAGGGAGGATTTTATGGAG AACCTTTTCAAAACCCACA
rs562052 ACGTTGGATGCTCCAGGCTAGTGGAATAAC ACGTTGGATGCTACTGCACTGATCGTGTTC CAGATTCAAATGCCATAGCA
rs2858059 ACGTTGGATGCAGTAAGTATTTCTGGGGTG ACGTTGGATGCTCCCATGATACAATGAAGG TGGGGTGGATAAATGAATAG
rs1062099 ACGTTGGATGGACCCGGTCCTGATTTTAAC ACGTTGGATGTGTGTTTCTGCCGCTTCAGT TTTAACAGTAGACTTGAGAAG
rs10739971 ACGTTGGATGCCTAATAAGACCACTTAGTGT ACGTTGGATGATGCACTAACATACAACGAG CCACCTACTCATTTATCCCATG
rs2858060 ACGTTGGATGACTGTATTATCCTCAGTTC ACGTTGGATGACTTGGGTAATCTAGCAATG GTATTATCCTCAGTTCGTAACA
rs2858061 ACGTTGGATGGCTTTCAATACTACAAGGG ACGTTGGATGAATGATACCTTTCATAGGGG GTAAAACAAAAACAGGTAAGAG
rs35301225 ACGTTGGATGGGCAGTATACTTGCTGATTG ACGTTGGATGGCTGTGAGTGTTTCTTTGGC GGATTATTGCTCACAACAACCAG
rs1547354 ACGTTGGATGTTGCAGGTTTTGGCTTGTTC ACGTTGGATGGGAGGTTAGTAGTCCTTCTA TTTGATTCAACTGTTAGAAATGTG
rs13137 ACGTTGGATGAGGTGAAAGAGATGAACCAC ACGTTGGATGAAAGCATTCCCAAAATGCTC TCCCAAAATGCTCTATTTTAGATAG
rs10761322 ACGTTGGATGGCTTTTGGTTACTAAATCAC ACGTTGGATGCTTCATATTTAGGAGGTAGC GGCATATTTAGGAGGTAGCTACTAC
rs693120 ACGTTGGATGGTAGATGGCACATATAGAAA ACGTTGGATGCATCCCTTAACTGTAAGTTC GATTGTCAAATGAAAAGAAGAATAT
rs1143770 ACGTTGGATGCTGAACAATTTAATGCCTTC ACGTTGGATGTTCAGTTTTACCAGAGGAAC CCCCCATGCCTTCTGATATCTGTTGA
rs77585961 ACGTTGGATGGTTTCCTTCTCTGCAAGACG ACGTTGGATGCACTTACTATGCAGGAAGGC CCTACATGATGTAATACACTTACAATA
rs7050391 ACGTTGGATGGTAAGGCAGTATGATTAGGC ACGTTGGATGGCCTCAACTGTCAAAGATTG TGTTCATAATTATTATCAGAAGGCATA
rs3851812 ACGTTGGATGTTTTCCTCCCAAGCAAAAC ACGTTGGATGTTCTTGCCGTTCTGTAAGTG GGTGGAAGTGTTTTATTCTTAGTGTGA
rs629367 ACGTTGGATGTATGCAGCATTTTTGTGAC ACGTTGGATGATTCTGTTTCCTCGGGTTAG GGGGTCAGCATTTTTGTGACAATGGACA