Table 3.

Frequency table of 3′ and 5′ trimmings.

(A) Frequency table of 3′ trimming
Library	G	TG	A	C	T	GA	TT	GT	CA	CC	GC	TA	AA	CT	AG	CG	Others
SRX018957	38	14.4	5.69	11.4	13.3	0.49	3.17	0.26	0.03	0.33	0.2	0.45	0.37	0.24	0.16	0.04	11.5
SRX018958	37.1	7.38	12.2	12	7.27	2.55	1.76	1.08	0.76	0.9	0.21	0.35	0.48	0.22	0.14	0.12	15.56
SRX018959	45.6	7.87	8.13	10.3	6.64	2.48	1.63	1.05	0.82	0.74	0.2	0.24	0.36	0.16	0.14	0.08	13.61
SRX018960	31.6	14.9	19.6	10.6	5.67	0.64	1.41	0.76	0.7	0.24	0.43	0.79	0.58	0.22	0.2	0.01	11.62
SRX018961	20.3	23	22.3	8.27	6	1.65	1.95	0.79	0.58	0.28	0.45	0.92	0.33	0.25	0.18	0.03	12.8
SRX018962	33.3	17.8	9.58	7.49	5.51	1.39	2.06	2.25	1.04	0.35	0.63	0.37	0.4	0.2	0.23	0.03	17.35
SRX018963	30.6	15.4	12.8	7.65	8.75	1.23	2.41	1.78	1.02	0.38	0.54	0.54	0.39	0.22	0.21	0.05	16.12
SRX018964	33	13.2	12.3	8.85	8.82	1.34	2.12	1.55	1.02	0.37	0.63	0.42	0.5	0.28	0.18	0.05	15.36
SRX018965	34.4	12.8	8.28	8.65	3.9	2.8	0.48	5.93	1.93	0.47	0.54	0.15	0.31	0.9	0.32	0.31	17.87
SRX018966	42.6	8.14	10.7	8.5	8.49	4.06	1.98	1.11	0.75	0.74	0.25	0.28	0.3	0.27	0.11	0.16	11.62
SRX018967	50.5	7.96	4.69	13.8	4.57	4.42	1.08	0.76	0.81	0.94	0.43	0.1	0.1	0.13	0.07	0.08	9.59
SRX018968	40.8	11.2	7.52	5.14	8.62	4.04	3	1.66	0.79	0.52	0.22	0.31	0.29	0.37	0.19	0.21	15.21
SRX018969	45.8	13.2	7.02	8.51	4.66	3.89	1.34	1.32	0.58	0.72	0.21	0.24	0.27	0.19	0.11	0.12	11.82
SRX018970	41.9	7.62	12.8	9.04	6.1	3.59	1.4	1.23	0.81	0.71	0.22	0.39	0.51	0.3	0.15	0.21	13.07
SRX018971	15	3.36	11	11.5	12.9	13.9	2.9	2.26	2.29	1.02	0.45	0.06	0.21	0.67	1.34	0.35	20.81
Average	36	11.9	11	9.43	7.41	3.23	1.91	1.59	0.93	0.58	0.38	0.37	0.36	0.31	0.25	0.12	14.26