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. 2015 Dec 7;10(12):e0143981. doi: 10.1371/journal.pone.0143981

Table 6. Diversity and frequency of single-nucleotide polymorphisms displayed by Giardia duodenalis assemblage B isolates at the beta giardin locus (partial sequence between positions 107 to 575) identified in the present study.

Novel sub-types were shown underlined. Point mutations inducing amino acid substitutions were highlighted as superscript numbers indicating the amino acid change. Transversion mutations were highlighted in bold.

Nucleotide at position of reference sequence AY072727.1
126 132 133 159 165 171 183 186 189 218 228 240 256 258 274 283 309 324 325 340 345 347 354 393 426 427 453 454 455 456 471 484 485 519 520 543 564
C T G G C A A G G T A T C G A A C C A G G A G C C G C G A G T G A T G C C
Isolate Number of isolates Cluster
KT310382 1 1 T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
KT310383 1 1 . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
KT310384 1 1 . . . . . . . . . . . . . . . . Y . . . . . . . . . . . . . . . . Y . . .
KT310385 1 2 . . A 1 A T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310386 35 2 . . . A T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310387 1 2 . . . A T . . R . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310388 1 2 . . . A T . . . . Y 2 . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310389 1 2 . . . A T . . . . . . . Y . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310390 1 2 . . . A T . . . . . . . . . R 4 . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310391 1 2 . . . A T . . . . . . . . . . . T T R 6 . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310392 1 2 . . . A T . . . . . . . . . . . T T . . . R 8 . T . . . . R 11 . C . . . . . .
KT310393 1 2 . . . A T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . Y . . .
KT310394 1 2 . . . R T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310395 2 2 . . . R T . . . . . . . . . . . T Y . . . . . T . . . . . . Y . . . . . .
KT310396 2 2 . . . . T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310397 1 2 . . . . T . . . . . . . . . R 4 . T T . . . . . T . . . . . . C . . . . . .
KT310398 1 2 . . . . T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T Y . . . . . C . . . . . .
KT310399 1 2 . . . . T . . . . . . . . . . . T T . . . . . T . . . . . . C . . . R 14 . .
KT310400 4 2 . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
KT310401 1 2 . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . R 13 . . . .
KT310402 1 3 . Y . A Y R R . . . R . . R . . T T . . . . . T . . M . . R C . . . . . .
KT310403 1 4 . . . . Y . R . R . . . . . . . T Y . . . . . Y . . . . . . . . . Y . . Y
KT310404 1 5 . . . . T . . . . . . . . . . . T . . R 7 R . . . . R 9 . R 10 . . . R 12 . . . T .
KT310405 1 6 . . . . . . R . . . . Y 3 M . . R 5 Y . . . . . R . . . . . . . . . . . . . .
KT310406 1 7 . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T

M: A/CA; R: A/G; Y: C/T.

1p.V47M.

2p.I75T.

3p.L88M.

4p.I94V.

5p.M97V.

6p.T111A.

7p.E116K.

8p.N118S.

9p.E145K.

10p.E154K.

11p.E154G.

12p.E164K.

13p.E164G.

14p.A176T.