Table S1.

List of primers and primer indexes used in the study

			Bac primers	Arch primers
			>343F	> ARC787F
			TACGGRAGGCAGCAG	ATTAGATACCCSBGTAGTCC
			>802R	>A1053R
			TACNVGGGTATCTAATCC	CATGCACCWCCTCTC
#	Barcode	Linker	Barcoded F_bact_primer	Barcoded F_arch_primer
1	TTATCCG	TA	TTATCCGTATACGGRAGGCAGCAG	TTATCCGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
2	TTATGGC	TA	TTATGGCTATACGGRAGGCAGCAG	TTATGGCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
3	TTACACC	TA	TTACACCTATACGGRAGGCAGCAG	TTACACCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
4	TTACGTG	TA	TTACGTGTATACGGRAGGCAGCAG	TTACGTGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
5	TTAGAGG	TA	TTAGAGGTATACGGRAGGCAGCAG	TTAGAGGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
6	TTAGCTC	TA	TTAGCTCTATACGGRAGGCAGCAG	TTAGCTCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
7	TTCTTCC	TA	TTCTTCCTATACGGRAGGCAGCAG	TTCTTCCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
8	TTCTCGT	TA	TTCTCGTTATACGGRAGGCAGCAG	TTCTCGTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
9	TTCTGAG	TA	TTCTGAGTATACGGRAGGCAGCAG	TTCTGAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
10	TTCAACG	TA	TTCAACGTATACGGRAGGCAGCAG	TTCAACGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
11	TTCAGTC	TA	TTCAGTCTATACGGRAGGCAGCAG	TTCAGTCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
12	TTCCAGA	TA	TTCCAGATATACGGRAGGCAGCAG	TTCCAGATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
13	TTCGTTG	TA	TTCGTTGTATACGGRAGGCAGCAG	TTCGTTGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
14	TTCGCAA	TA	TTCGCAATATACGGRAGGCAGCAG	TTCGCAATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
15	TTGTCAC	TA	TTGTCACTATACGGRAGGCAGCAG	TTGTCACTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
16	TTGTGCT	TA	TTGTGCTTATACGGRAGGCAGCAG	TTGTGCTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
17	TTGAAGC	TA	TTGAAGCTATACGGRAGGCAGCAG	TTGAAGCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
18	TTGACTG	TA	TTGACTGTATACGGRAGGCAGCAG	TTGACTGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
19	TTGCTAG	TA	TTGCTAGTATACGGRAGGCAGCAG	TTGCTAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
20	TTGGTGT	TA	TTGGTGTTATACGGRAGGCAGCAG	TTGGTGTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
21	TTGGACA	TA	TTGGACATATACGGRAGGCAGCAG	TTGGACATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
22	TATTCGC	TA	TATTCGCTATACGGRAGGCAGCAG	TATTCGCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
23	TATAGCC	TA	TATAGCCTATACGGRAGGCAGCAG	TATAGCCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
24	TAACCAC	TA	TAACCACTATACGGRAGGCAGCAG	TAACCACTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
25	TAAGGAG	TA	TAAGGAGTATACGGRAGGCAGCAG	TAAGGAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
26	TACTCCA	TA	TACTCCATATACGGRAGGCAGCAG	TACTCCATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
27	TACACAG	TA	TACACAGTATACGGRAGGCAGCAG	TACACAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
28	TACCGAA	TA	TACCGAATATACGGRAGGCAGCAG	TACCGAATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
29	TAGTACC	TA	TAGTACCTATACGGRAGGCAGCAG	TAGTACCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
30	TAGTGTG	TA	TAGTGTGTATACGGRAGGCAGCAG	TAGTGTGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
31	TAGCCTA	TA	TAGCCTATATACGGRAGGCAGCAG	TAGCCTATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
32	TCTACCT	TA	TCTACCTTATACGGRAGGCAGCAG	TCTACCTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
33	TCAAGCA	TA	TCAAGCATATACGGRAGGCAGCAG	TCAAGCATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
34	TCACAAG	TA	TCACAAGTATACGGRAGGCAGCAG	TCACAAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
35	TCAGACT	TA	TCAGACTTATACGGRAGGCAGCAG	TCAGACTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
36	TGTTGCA	TA	TGTTGCATATACGGRAGGCAGCAG	TGTTGCATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
37	TGTACTC	TA	TGTACTCTATACGGRAGGCAGCAG	TGTACTCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
38	TGTAGGT	TA	TGTAGGTTATACGGRAGGCAGCAG	TGTAGGTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
39	TGTGTAG	TA	TGTGTAGTATACGGRAGGCAGCAG	TGTGTAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
40	ATTAGCG	TA	ATTAGCGTATACGGRAGGCAGCAG	ATTAGCGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
41	ATTCCTC	TA	ATTCCTCTATACGGRAGGCAGCAG	ATTCCTCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
42	ATTGACC	TA	ATTGACCTATACGGRAGGCAGCAG	ATTGACCTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
43	ATCTGCA	TA	ATCTGCATATACGGRAGGCAGCAG	ATCTGCATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
44	ATGAGGA	TA	ATGAGGATATACGGRAGGCAGCAG	ATGAGGATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
45	AATTCCG	TA	AATTCCGTATACGGRAGGCAGCAG	AATTCCGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
46	AATCGTG	TA	AATCGTGTATACGGRAGGCAGCAG	AATCGTGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
47	AGTTGAG	TA	AGTTGAGTATACGGRAGGCAGCAG	AGTTGAGTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
48	AGCAGAA	TA	AGCAGAATATACGGRAGGCAGCAG	AGCAGAATAATTAGATACCCSBGTAGTCC
49	CTTGAGT	TA	CTTGAGTTATACGGRAGGCAGCAG	CTTGAGTTAATTAGATACCCSBGTAGTCC
50	CTCCAAT	TA	CTCCAATTATACGGRAGGCAGCAG	CTCCAATTAATTAGATACCCSBGTAGTCC