Table 1.
Clade | Genotype |
State(s) | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
H1 |
H3 |
||||||||||||
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 1 | 2 | 3 | ||
Singleton 1 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | … | IN |
Singleton 2 | … | × | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | TX |
Singleton 3 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | … | TX |
Singleton 4 | … | … | … | … | … | × | … | … | … | … | … | TX | |
Clade 1 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | … | OH |
Clade 2 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | … | OH |
Clade 3 | … | … | … | × | × | … | × | × | × | × | × | × | IN, OH |
Clade 4 | … | … | … | × | … | … | … | … | … | … | … | … | IN |
Clade 5 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | … | IN |
Clade 6 | … | … | … | … | × | … | … | … | … | … | … | … | IN |
Clade 7 | … | … | … | × | … | … | … | … | … | … | … | … | IA |
Clade 8 | … | … | × | … | … | … | … | … | … | … | … | … | OH |
Clade 9 | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | × | … | IN, OH |
Clade 10 | … | … | … | × | … | … | … | … | … | … | … | … | TX |
Clade 11 | × | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | TX |
Clade 12 | … | … | … | × | … | … | … | × | … | × | … | … | IN, OH |
Clades refer to those indicated in Figure 5 and Supplementary Figure 1. Genotypes refer to those listed in Figure 3A.