Strand	Domain	Sequence	Length (nt)
JoinAB-Bottom	tq* r* tr* b* tb* a* ta*	CTGG­TT GTGA­GACT­CGGT­TAAG­CAAT­G GTAG­GA TTCG­GACT­CTAA­GGTG­CAAT­G GTGG­AA GGAT­GACT­CGTA­GAAG­CAAT­G TAGC­AG	87
FORKBC-Bottom	tq* r* tr* b* tb* c* tc* i*	CTGG­TT GTGA­GACT­CGGT­TAAG­CAAT­G GTAG­GA TTCG­GACT­CTAA­GGTG­CAAT­G GTGG­AA AAGG­GACT­CGAT­GTGG­CAAT­G TGGG­TA TGGT­GACT­CTTA­TGAT­GGCA­G	108
<ta a>		CTGC­TA CATT­GCTT­CTAC­GAGT­CATC­C	27
<tb b>	ta a	TTCC­AC CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A	27
<tc c>	tb b	TACC­CA CATT­GCCA­CATC­GAGT­CCCT­T	27
<a tb>	tc c	CATT­GCTT­CTAC­GAGT­CATC­C TTCC­AC	27
<b tr>	a tb	CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A TCCT­AC	27
<r tq>	b tr	CATT­GCTT­AACC­GAGT­CTCA­C AACC­AG	27
<i>	r tq	CTGC­CATC­ATAA­GAGT­CACC­A	21
<tr r>	i	TCCT­AC CATT­GCTT­AACC­GAGT­CTCA­C	27
<i tc>	tr r	CTGC­CATC­ATAA­GAGT­CACC­A TACC­CA	27
<c tr>	i tc	CATT­GCCA­CATC­GAGT­CCCT­T TCCT­AC	27
<c tb>	c tr	CATT­GCCA­CATC­GAGT­CCCT­T TTCC­AC	27
<b tr>	c tb	CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A TCCT­AC	27
<i tb>	b tr	CTGC­CATC­ATAA­GAGT­CACC­A TTCC­AC	27
<b tb>	i tb	CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A TTCC­AC	27
<b tc>	b tb	CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A TACC­CA	27
<c tr>	b tc	CATT­GCCA­CATC­GAGT­CCCT­T TCCT­AC	27
<b tr>	c tr	CATT­GCAC­CTTA­GAGT­CCGA­A TCCT­AC	27
ROX-<c* tc*>	b tr	/56-ROXN/ AAGG­GACT­CGAT­GTGG­CAAT­G TGGG­TA	27
<c>-RQ	c* tc*	CATT­GCCA­CATC­GAGT­CCCT­T /3IAbRQSp/	21
<tq* r*>-TAMRA	c	CTGG­TT GTGA­GACT­CGGT­TAAG­CAAT­G /36-TAMTSp/	27
RQ-<r>	tq* r*	/5IAbRQ/ CATT­GCTT­AACC­GAGT­CTCA­C	21
	r