Table 3.
Number of different breakpoints and physical length of chromosomes
Chromosome/chromosome arm | Physical length (Mb) | Prospective group | Retrospective group | ||
---|---|---|---|---|---|
before SCT | after 3 months | after 12 months | |||
1p | 128 | 1 | 10 | 5 | 23 |
1q | 135 | 1 | 3 | 23 | 16 |
1 | 263 (8,0 %) | 3 | 13 (5,8 %) | 30 (12,7 %) | 39 (10,3 %) |
2p | 99 | - | 10 | 5 | 12 |
2q | 156 | - | 12 | 9 | 15 |
2 | 255 (7,7 %) | - | 22 (9,9 %) | 14 (5,9 %) | 27 (7,1 %) |
3p | 99 | - | 9 | 9 | 10 |
3q | 115 | - | 10 | 9 | 14 |
3 | 214 (6,5 %) | - | 19 (8,5 %) | 19 (8,1 %) | 24 (6,3 %) |
4p | 56 | - | - | 7 | 4 |
4q | 147 | - | 7 | 5 | 15 |
4 | 203 (6,2 %) | - | 7 (3,1 %) | 12 (5,1 %) | 21 (5,5 %) |
5p | 52 | - | 1 | 5 | 4 |
5q | 142 | 1 | 12 | 3 | 15 |
5 | 194 (5,9 %) | 1 | 13 (5,8 %) | 9 (3,8 %) | 21 (5,5 %) |
6p | 65 | - | 6 | 6 | 14 |
6q | 118 | - | 9 | 6 | 6 |
6 | 183 (5,6 %) | - | 15 (6,7 %) | 12 (5,1 %) | 21 (5,5 %) |
7p | 65 | - | 9 | 4 | 5 |
7q | 106 | - | 9 | 5 | 10 |
7 | 171 (5,2 %) | - | 18 (8,1 %) | 9 (3,8 %) | 15 (4,0 %) |
8p | 50 | - | 3 | 1 | 8 |
8q | 105 | - | 4 | 4 | 13 |
8 | 155 (4,7 %) | - | 7 (3,1 %) | 5 (3,4 %) | 21 (5,5 %) |
9p | 51 | - | 6 | 2 | 3 |
9q | 94 | - | 5 | 4 | 15 |
9 | 145 (4,4 %) | - | 11 (4,9 %) | 6 (2,6 %) | 18 (4.7 %) |
10p | 44 | - | 2 | 6 | 5 |
10q | 100 | - | 6 | 6 | 15 |
10 | 144 (4,4 %) | - | 9 (4,0 %) | 12 (5,1 %) | 22 (5,8 %) |
11p | 58 | - | 5 | 3 | 2 |
11q | 86 | - | 5 | 7 | 6 |
11 | 144 (4,4 %) | - | 10 (4,5 %) | 10 (4,2 %) | 9 (2,4 %) |
12p | 39 | - | 4 | 2 | 3 |
12q | 104 | 1 | 4 | 5 | 6 |
12 | 143 (4,3 %) | 1 | 8 (3,6 %) | 7 (2,9 %) | 9 (2,4 %) |
13p | 16 | - | - | 1 | 3 |
13q | 98 | - | 7 | 9 | 11 |
13 | 114 (3,5 %) | - | 8 (3,6 %) | 11 (4,7 %) | 14 (3,7 %) |
14p | 16 | - | 1 | 1 | - |
14q | 93 | 1 | 9 | 13 | 20 |
14 | 109 (3,3 %) | 1 | 11 (6,3 %) | 14 (5,9 %) | 22 (5,8 %) |
15p | 17 | - | 2 | 4 | 6 |
15q | 89 | - | 6 | 7 | 9 |
15 | 106 (3,2 %) | - | 9 (6,7 %) | 11 (4,7 %) | 15 (3,9 %) |
16 | 98 (3,0 %) | - | 10 (4,5 %) | 9 (3,8 %) | 16 (4,2 %) |
17 | 92 (2,8 %) | 1 | 8 (3,6 %) | 6 (2,6 %) | 16 (4,2 %) |
18 | 85 (2,6 %) | 1 | 5 (2,2 %) | 6 (2,6 %) | 12 (3,2 %) |
19 | 67 (2,0 %) | - | 6 (2,7 %) | 4 (1,7 %) | 6 (2,4 %) |
20 | 72 (2,2 %) | - | 6 (2,7 %) | 7 (3,0 %) | 10 (2,6 %) |
21 | 50 (1,5 %) | 1 | 5 (2,3 %) | 5 (2,1 %) | 2 (0,5 %) |
22 | 56 (1,7 %) | 1 | 3 (1,4 %) | 5 (2,1 %) | 3 (0,8 %) |
Xp | 62 (1,9 %) | - | - | 4 | 10 |
Xq | 102 (3,1 %) | - | 1 | 6 | 10 |
X | 164 (5,0 %) | - | 2 (0,9 %) | 10 (4,3 %) | 22 (5,8 %) |
Y | 59 (1,8 %) | - | 1 (0,5 %) | 1 (0,4 %) | - |
Sum of breakpoints: | 10 | 222 | 235 | 379 |
Legend to Table 3: Physical length of chromosome arms is given in Mb = Megabases according to [28]. Distribution of breakpoints is shown for chromosome arms and for whole chromosomes. In a few cases (mainly due to derivative chromosomes), breakpoints could only be localized to a chromosome, but not to a certain chromosome arm. Distribution of the breakpoints on the shorter chromosomes 16–22 and Y (chromosome groups E-G) is only shown for the whole chromosome and not for chromosome arms