Table 4. Primers used for UDS analysis.
| AMPLICON | MID | SEQUENCE 5′ to 3′ |
|---|---|---|
| 1 | 1 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGAGTGC GTTTGGACCTGGAAGAAGTGTTCA -3′ |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGAGTGCGTCGGTCACCTGTACCATCTGTAG -3′ | ||
| 2 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGCTCGACATTGGACCTGGAAGAAGTGTTCA -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGCTCGACACGGTCACCTGTACCATCTGTAG -3′ | ||
| 3 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGAGACGCACTCTTGGACCTGGAAGAAGTGTTCA -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGAGACGCACTCCGGTCACCTGTACCATCTGTAG -3′ | ||
| 2 | 1 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGAGTGCGTTTTAACCCTGCTAATTTGTCAC -3′ |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGAGTGCGTATGAGTGCCTCTCTTTCAGA -3′ | ||
| 2 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGCTCGACATTTAACCCTGCTAATTTGTCAC -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGCTCGACAATGAGTGCCTCTCTTTCAGA -3′ | ||
| 4 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGAGCACTGTAGTTTAACCCTGCTAATTTGTCAC -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGAGCACTGTAGATGAGTGCCTCTCTTTCAGA -3′ | ||
| 3 | 1 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGAGTGCGTAATCCAGGTTGCCGTCAA -3′ |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGAGTGCGTATTCAATTTCATCTTCAGAGTGA -3′ | ||
| 2 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGCTCGACAAATCCAGGTTGCCGTCAA -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGCTCGACAATTCAATTTCATCTTCAGAGTGA -3′ | ||
| 4 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGAGCACTGTA GAATCCAGGTTGCCGTCAA -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGAGCACTGTAGATTCAATTTCATCTTCAGAGTGA -3′ | ||
| 4 | 1 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGAGTGCGTGGTTCAAGAGAAGTTCAGATAC -3′ |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGAGTGCGTTAATGGTGTAGATGCCTTCA -3′ | ||
| 2 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGCTCGACAGGTTCAAGAGAAGTTCAGATAC -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGCTCGACATAATGGTGTAGATGCCTTCA -3′ | ||
| 4 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGAGCACTGTAGGGTTCAAGAGAAGTTCAGATAC -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGAGCACTGTAGTAATGGTGTAGATGCCTTCA -3′ | ||
| 5 | 2 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGACGCTCGACACATGAGTGATTCCAACTATGTT -3′ |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGACGCTCGACACTGATACATCGCTTCTTCTG -3′ | ||
| 4 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGAGCACTGTAGCATGAGTGATTCCAACTATGTT -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGAGCACTGTAGCTGATACATCGCTTCTTCTG -3′ | ||
| 5 | FOR 5′- CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGATCAGACACGCATGAGTGATTCCAACTATGTT -3′ | |
| REV 5′- CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGATCAGACACGCTGATACATCGCTTCTTCTG -3′ |
The primers cover exons 11–24 of the FLT3 gene. Each forward and reverse primer consists of an adapter sequence for emulsion PCR, a sample specific barcode sequence (multiplex identifier) that allows sample pooling and a gene-specific sequence.