Table 4.

P-values of the four methods for detecting the genes in the PI3K-AKT signaling pathway and Notch signaling pathway

Gene	NetDifM	NetDifMpm	VEWDM	Yates’D
PI3K-AKT signaling pathway
KRAS	0.19521	0.190	0.551	0.499
PIK3CA	0.49654	0.531	0.531	0.891
IRS1	0.06622	0.066	0.031	0.207
PDPK1	0.05108	0.042	0.032	0.143
AKT1	0.13639	0.146	0.065	0.712
MDM2	0.03568	0.035	0.011	0.484
TP53	0.08385	0.083	0.136	0.102
Notch signaling pathway
DLL3	0.05909	0.062	0.081	0.559
DTX2	0.42435	0.412	0.202	0.122
CREBBP	0.20470	0.220	0.191	0.650
PTCRA	0.51705	0.507	0.421	0.192
JAG1	0.03144	0.027	0.036	0.142
DVL2	0.00124	<0.001	<0.001	0.639
SNW1	0.71303	0.706	0.309	0.124
HES1	0.01032	0.002	0.035	0.995
RBPJ	0.00001	<0.001	<0.001	0.646
NOTCH2	0.00014	<0.001	<0.001	0.095
PSENEN	0.42405	0.435	0.102	0.032
ADAM17	0.00701	0.009	0.009	0.326
NUMB	0.10758	0.098	0.065	0.100
NCOR2	0.00021	<0.001	<0.001	0.344