Table 2.

Transcriptome data of selected novel genes regulated under specific conditions given as fold-change compared to standard LB^a. Data are taken from [9]

Name b	Minimal medium	LB-Nit	pH9	Radish sprouts	Spinach leaf juice	15 °C	Amoeba	Antibiotics	Cow dung	Agar surface	pH4
X009*	u/c	n.r.	9	u/c	u/c	n.r.	70	u/c	u/c	n.r.	n.r.
X011*	12	u/c	6	8	26	13	151	n.r.	n.r.	19	21
X031	u/c	u/c	u/c	u/c	26	u/c	u/c	u/c	u/c	u/c	−18
X037	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.	213	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.
X048	n.r.	- u/c	u/c	u/c	n.r.	u/c	n.r.	48	n.r.	n.r.	u/c
X052*	n.r.	−6	−5	n.r.	u/c	u/c	12	n.r.	n.r.	n.r.	−5
X060	u/c	7	u/c	5	10	18	u/c	−17	u/c	u/c	u/c
X062	25	14	12	n.r.	u/c	7	23	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.
X070	n.r.	n.r.	u/c	n.r.	n.r.	u/c	25	n.r.	n.r.	n.r.	n.r.
X071	122	14	9	5	u/c	u/c	n.r.	n.r.	5	n.r.	n.r.

^apositive values, up regulated; negative values, down regulated; n.r., no reads under this condition; u/c, unchanged (threshold ≥5-fold regulation)

^bThe asterisk indicates genes not annotated in any other organism (see Table 1)