Table 4. Identification of Leishmania in clinical and experimentally infected and field samples by the HRM analysis targeting hsp70 gene.
Sample Source | HRM Identification | Previous Diagnosis | Method | |
---|---|---|---|---|
Amplicon 1 | Amplicon 2 | |||
Humana | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (Viannia) sp. | SSU + seq |
Humana | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (Viannia) sp. | SSU + seq |
Humana | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (Viannia) sp. | SSU + seq |
Humana | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Humanb | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Humanb | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Humanb | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Humanc | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Humand | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (Viannia) sp. | SSU + seq |
Caninea | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (Viannia) sp. | SSU + seq |
Caninea | L. (L.) infantum chagasi | N/A | L. (L.) infantum chagasi | SSU + seq |
Mousee | L. (L.) amazonensis | N/A | L. (L.) amazonensis | SSU + seq |
Mousee | L. (L.) amazonensis | N/A | L. (L.) amazonensis | SSU + seq |
Mousee | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |
Phlebotominef | L. (L.) infantum chagasi | N/A | L. (L.) infantum chagasi | SSU + seq |
Phlebotomineg | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | L. (V.) braziliensis | g6pd PCR |