Table 2.
Tabular overview of 33 ticks additionally identified by COI molecular typing
| Morphological identification | BOLD identification | GenBank identification | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Tick ID | COI gene length [bp] | Origin | Species ID | Species ID (Identity) | Species ID (Accession Nr.) | Identity |
| 154 | 711 | Field | A. gemma | A. gemma (99.80 %) | no reliabe ID | |
| 183 | 688 | Field | A. gemma | A. gemma (100 %) | no reliabe ID | |
| 32 | 687 | Field | A. hebraeum | A. gemma (100 %) | no reliabe ID | |
| 109 | 686 | Field | A. hebraeum | A. gemma (99.70 %) | no reliabe ID | |
| 36 | 692 | Lab | A. variegatum | A. variegatum (100 %) | A. variegatum (GU062743.1) | 97 % |
| 86 | 651a | Field | A. variegatum | A. variegatum (99.70 %) | A. variegatum (GU062743.1) | 99 % |
| 242 | 702 | Lab | A. variegatum | A. variegatum (100 %) | A. variegatum (GU062743.1) | 97 % |
| 27 | 688 | Field | H. dromedarii | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437071.1) | 99 % |
| 74 | 688 | Field | H. dromedarii | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437061.1) | 99 % |
| 118 | 680 | Field | H. dromedarii | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437071.1) | 99 % |
| 34 | 688 | Lab | H. sp. | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437061.1) | 99 % |
| 112 | 686 | Lab | H. sp. | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437061.1) | 99 % |
| 194 | 680 | Lab | H. sp. | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437061.1) | 99 % |
| 207 | 686 | Lab | H. sp. | H. dromedarii (100 %) | H. dromedarii (AJ437061.1) | 99 % |
| 139 | 689 | Field | H. m. rufipes | H. m. rufipes (99.84 %) | H. m. rufipes (AJ437100.1) | 99 % |
| H. truncatum (AJ437088.1) | 99 % | |||||
| 359 | 688 | Field | H. m. rufipes | H. m. rufipes (99.12 %) | H. m. rufipes (AJ437095.1) | 99 % |
| 72 | 684 | Field | H. truncatum | H. truncatum (99 %) | H. truncatum (AJ437084.1) | 97 % |
| 361 | 555a | Field | H. truncatum | H. truncatum (98 %) | H. truncatum (AJ437084.1) | 97 % |
| 38 | 693 | Lab (Kiambu) | R. appendiculatus | R. appendiculatus (99.50 %) | R. appendiculatus (AF132833.1) | 97 % |
| 121 | 687 | Lab (Muguga) | R. appendiculatus | R. appendiculatus (99.50 %) | R. appendiculatus (AF132833.1) | 98 % |
| 198 | 679 | Lab (Muguga) | R. appendiculatus | R. appendiculatus (99.50 %) | R. appendiculatus (AF132833.1) | 98 % |
| 225 | 687 | Field | R. appendiculatus | R. appendiculatus (99.85 %) | R. appendiculatus (AF132833.1) | 99 % |
| 146 | 673 | Field | R. (B.) decoloratus | R. (B.) decoloratus (100 %) | R. (B.) decoloratus (AF132826.1) | 99 % |
| 278 | 690 | Lab | R. (B.) decoloratus | R. (B.) decoloratus (99.85 %) | R. (B.) decoloratus (AF132826.1) | 99 % |
| 165 | 585a | Lab | R. (B.) microplus | R. (B.) microplus (100 %) | R. (B.) microplus (KC503261.1) | 100 % |
| 377 | 689 | Field | R. (B.) microplus | R. (B.) microplus (100 %) | R. (B.) microplus (KC503261.1) | 99 % |
| 170 | 694 | Field | R. evertsi evertsi | R. evertsi evertsi (100 %) | R. evertsi evertsi (AF132835.1) | 98 % |
| 275 | 688 | Lab | R. evertsi evertsi | R. evertsi evertsi (100 %) | R. evertsi evertsi (AF132835.1) | 98 % |
| 370 | 688 | Field | R. praetextatus | no reliabe ID | no reliabe ID | |
| 396 | 702 | Field | R. praetextatus | no reliabe ID | no reliabe ID | |
| 397 | 702 | Field | R. pulchellus | R. pulchellus (98 %) | R. pulchellus (AY008682.1) | 99 % |
| 29 | 701 | Field | R. simus | no reliabe ID | no reliabe ID | |
| 115 | 690 | Field | R. simus | no reliabe ID | no reliabe ID |
ano consensus sequence
Marked in bold: Ticks later used for SSp. design
No reliable ID: Identity with top match < 97 %