Table 4.
MTB/GF genes listed below | 1q32.1 |
3q26.2 |
3q26.32 |
4q12 |
7p11.2 |
7q21.2 |
8q12.1 |
8q24.13 |
8q24.21 |
11q13.3 |
12p13.32 |
12q14.1 |
15q25.1 |
20q13.32 |
Xq25 |
|||||
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MDM4 | PIK3C2B | EVI1 | PIK3CA | PDGFRA | EGFR | CDK6 | MOS | RNF139 | MYC | CCND1 | CTTN | FGF3 | FGF4 | CCND2 | CYP27B1 | CDK4 | BCL2A1 | GNAS | XIAP | |
1p13.3 SLC16A4 |
||||||||||||||||||||
− | − | − | + | 0.28 | + | − | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | 0.24 | 0.22 | + | |
4q25 EGF |
||||||||||||||||||||
− | − | + | − | 0.39 | 0.25 | 0.37 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | |
7p22.3 PDGFA |
||||||||||||||||||||
− | − | − | − | 0.63 | 0.40 | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | 0.27 | − | |
8q21.2 CA3 |
||||||||||||||||||||
0.33 | 0.34 | 0.24 | + | − | + | + | 0.46 | 0.35 | 0.46 | − | − | − | − | − | 0.41 | 0.44 | 0.36 | + | 0.00 | |
11p15.1 LDHA LDHC |
||||||||||||||||||||
− | + | − | 0.28 | − | + | + | + | + | + | 0.28 | + | 0.21 | + | + | + | + | − | − | − | |
− | + | − | 0.27 | − | + | + | 0.26 | + | + | 0.42 | 0.31 | 0.37 | 0.30 | + | + | + | − | − | − | |
14q23.2 HIF1A |
||||||||||||||||||||
0.34 | 0.46 | − | + | 0.52 | + | − | − | − | − | + | − | − | − | 0.21 | − | − | 0.34 | 0.38 | − | |
15q22.2 CA12 |
||||||||||||||||||||
0.31 | 0.33 | + | + | − | + | − | + | 0.39 | + | + | − | − | − | − | + | + | 0.19 | − | − | |
17q21.2 ACLY |
||||||||||||||||||||
− | − | − | − | 0.31 | + | + | + | − | − | 0.36 | 0.33 | 0.34 | 0.30 | + | + | − | − | − | − | |
17q25.3 SLC16A3 |
||||||||||||||||||||
+ | 0.21 | − | − | 0.20 | + | − | 0.27 | 0.20 | 0.23 | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | |
19q13.33 GYS1 |
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+ | + | 0.30 | 0.33 | + | 0.21 | − | − | + | − | + | + | + | + | 0.26 | + | − | + | − | − | |
Similar patterns for the potential amplicons | 9 of 11 MTB/GF genes | 8 of 11 MTB/GF genes | 7 of 11 MTB/GF genes | 9 of 11 MTB/GF genes |