Table 2.
LCR block | Gene | Type | Case |
|||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | |||
Cc | POM121 | coding | − | − | + | + | ||||||
NSUN5C | noncoding | − | − | − | − | |||||||
TRIM74 | coding | − | − | − | − | |||||||
FKBP6-like | noncoding | − | − | − | ||||||||
Ac | STAG3L3 | noncoding | − | − | − | |||||||
PMS2L | noncoding | − | − | + | ||||||||
WBSCR19 | noncoding | − | − | |||||||||
Bc | GTF2IP | noncoding | + | − | − | |||||||
NCF1B | noncoding | + | − | − | − | + | − | |||||
GTF2IRD2P | noncoding | − | − | − | − | − | − | |||||
Cm | POM121B | noncoding | − | − | − | − | + | − | ||||
NUSN5 | coding | − | + | − | − | − | − | − | ||||
TRIM50 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
FKBP6 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
Single-copy gene | FZD9 | coding | − | − | − | − | − | − | − | |||
BAZ1B | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
BCL7B | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
TBL2 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
MLXIPL | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
VPS37D | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
DNAJC30 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
WBSCR22 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
STX1A | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
ABHD11 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
CLDN3 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
CLDN4 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
WBSCR27 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
WBSCR28 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
ELN | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
LIMK1 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
EIF4H | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
LAT2 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
RFC2 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
CLIP2 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
GTF2IRD1 | coding | − | − | − | − | − | − | − | ||||
WBSCR23 | unknown | − | − | − | − | − | − | − | ||||
Bm | GTF2I | coding | + | + | + | + | − | − | − | |||
NCF1 | coding | − | − | − | ||||||||
GTF2IRD2 | coding | + | − | − | + | |||||||
Am | STAG3L2 | noncoding | − | − | − | |||||||
PMS2L5 | noncoding | − | − | − | ||||||||
GATSL | noncoding | − | − | + | ||||||||
WBSCR16 | coding | − | − | |||||||||
Bt | GTF2IED2B | coding | − | − | ||||||||
NCF1C | noncoding | − | − | |||||||||
GTF2IP1 | noncoding | + | + | |||||||||
At | GATSL | noncoding | ||||||||||
WBSCR19 | noncoding | |||||||||||
PMS2L | noncoding | |||||||||||
STAG3L1 | noncoding | |||||||||||
Ct | FKBP6-like | noncoding | ||||||||||
TRIM73 | coding | |||||||||||
NSUN5B | coding | |||||||||||
POM121 | coding |
− = Deleted genes within the microdeletions of each patient; + = genes disrupted by the breakpoints.