TABLE 2.
Gene (ORF) | Protein | Presence of coding regiona |
|||||||||||||
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Wild African elephant lung nodules |
Elephant NAP42 lung nodules (USA) |
SAM6/7 lung (Kenya) |
Elephant EP26 spleen (Spain) |
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EEHV2 (AfLng54) |
EEHV3 (AfLng47) |
EEHV3 (AfLng54) |
EEHV2 | EEHV3v1 and -v2 | EEHV6 | EEHV7 | EEHV2 | EEHV3 | EEHV6 | EEHV7 | EEHV2 | EEHV3 | EEHV6 | ||
U39 | gB | + | + | ||||||||||||
U38 | POL | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | ||
U33 | Cys-R | + | + | ||||||||||||
U28 | RRA | + | + | ||||||||||||
U27.5 | RRB | + | + | ||||||||||||
U27 | PPF | + | + | ||||||||||||
U45.7 | ORF-J | + | + | ||||||||||||
U46 | gN | + | + | ||||||||||||
U47 | gO | + | + | ||||||||||||
U48 | gH | + | + | ||||||||||||
U48.5 | TK | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | |||
U49 | + | + | + | − | − | ||||||||||
U50 | PAC2 | + | + | ||||||||||||
U51 | vGPCR1 | + | + | ||||||||||||
U57 | MCP | + | + | ||||||||||||
U60ex3 | TERex3 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | ||
U62 | + | + | |||||||||||||
U63 | + | ||||||||||||||
U66ex2 | TERex2 | + | + | ||||||||||||
U66ex1 | TERex1 | + | + | ||||||||||||
U70 | EXO | + | + | + | + | + | + | ||||||||
U71 | MyrTeg | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | |||
U72 | gM | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
U73 | OBP | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | |
U76 | POR | + | + | + | + | + | − | − | + | ||||||
U77 | HEL | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | |
U77.5 | ORF-M | + | + | ||||||||||||
U80.5 | ORF-N | + | + | ||||||||||||
U81 | UDG | + | + | + | + | + | + | ||||||||
U82 | gL | + | + | ||||||||||||
U82.5 | ORF-O | + | + | ||||||||||||
U85.5 | ORF-K | + | + | ||||||||||||
U86.5 | ORF-L | + | + |
+, present and amplified; −, presumed to be present but not able to be amplified.