Table 1. Contacts and hydrogen bonds involving the linker in the ADP-complexes.
| Subdomain | Residues | ADP (1) | ADP (2) | ADP-Api88 (1) | ADP-Api88 (2) | ADP-NR (1) | ADP-NR (2) | 2KHO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IA | ILE4 | VAL389(c) | ||||||
| GLU137 | THR395 (Hb) | |||||||
| LYS155 | LEU391(c) | VAL394(c) | VAL394(c) | |||||
| ARG159 | VAL394(c) | |||||||
| VAL165 | ASP393(c) | LEU391(c) | VAL394(c,Hb) | LEU392(c) | ||||
| ASP393(Hb) | ||||||||
| LYS166 | LEU391(c) | LEU391(Hb) | LEU390(c) | ASP393(c) | VAL389(c) | |||
| LEU392(c) | LEU392(c,Hb) | LEU392(c) | ||||||
| ASP393(Hb) | ||||||||
| ARG167 | LEU391(c) | LEU390(c) | THR383(c) | LEU390(c) | THR383(c) | LEU390(c) | ||
| GLY384(c) | ||||||||
| ILE168 | VAL389(c) | ASP388(c) | ||||||
| LEU391(c) | ||||||||
| linker | GLN378 | THR383(Hb) | THR383(Hb) | |||||
| GLY379 | THR383(Hb) | THR383(c,Hb) | ||||||
| GLY380 | GLY384(Hb) | VAL386(Hb) | VAL386(c) | |||||
| VAL381 | VAL386(c,Hb) | VAL386(Hb) | VAL386(c,Hb) | VAL386(c) | ||||
| LYS387(Hb) | ||||||||
| LEU382 | THR383(c) | THR383(c) | THR383(c) | LYS387(Hb) | THR383(c) | THR383(c) | ||
| ASP388(c,Hb) | ASP385(Hb) | VAL386(c) | ASP385(Hb) | |||||
| VAL386(c) | LYS387(Hb) | |||||||
| βSBD | LEU397 | LEU390(c) | PRO396(c) | PRO396(c) | PRO396(c) | THR395(c) | PRO396(c) | |
| PRO396(c) | PRO396(c) | |||||||
| LYS414 | THR395(c) | ASP393(c) | PRO396(c) | |||||
| PRO396(c) | ||||||||
| ASN415 | THR395(c,Hb) | THR395(c) | LEU391(c) | PRO396(c) | VAL394(c) | LEU390(c) | VAL394(Hb) | |
| LEU392(c) | PRO396(c) | ASP393(Hb) | THR395(Hb) | |||||
| ASP393(c) | PRO396(c) | |||||||
| THR416 | LEU391(c) | LEU391(c) | THR395(Hb) | LEU390(c) | ||||
| LEU392(Hb) | ||||||||
| PRO396(c) | ||||||||
| THR417 | VAL389(c) | |||||||
| LEU391(c) | ||||||||
| ILE418 | LEU390(c) | VAL389(c) | VAL389(c) | VAL389(c) | LEU390(Hb) | |||
| LEU390(Hb) | LEU390(Hb) | THR395(c) | LEU391(c,Hb) | |||||
| PRO396(c) | ||||||||
| PRO419 | LEU391(c) | ASP385(c) | ||||||
| ASP388(c) | ||||||||
| VAL389(c) | ||||||||
| LEU390(c) | ||||||||
| THR420 | GLY384(Hb) | |||||||
| HIS422 | THR383(c) | |||||||
| ALA480 | VAL389(c) | VAL389(Hb) | ||||||
| LEU390(Hb) | ||||||||
| ASP481 | ASP388(c,Hb) | LYS387(c,Hb) | VAL389(c) | LYS387(Hb) | ||||
| VAL389(Hb) | LEU390(c,Hb) | |||||||
| LEU391(Hb) | ||||||||
| GLY482 | VAL386(c) | |||||||
| LYS502 | VAL386(c) | |||||||
| αSBD | ALA503 | VAL386(c) | LEU391(c) | |||||
| SER504 | VAL389(c) | ASP385(c) | ||||||
| SER505 | ASP385(c) | THR395(Hb) | PRO396(c) | |||||
| GLY506 | THR395(Hb) | |||||||
| LEU507 | GLY384(c) | LEU391(c) | ||||||
| VAL386(c) | ||||||||
| PRO396(c) | ||||||||
| GLU509 | LEU390(c) | LEU391(c) | ||||||
| LEU391(c,Hb) | LEU392(c,Hb) | |||||||
| ILE512 | PRO396(c) | VAL394(c) | ||||||
| PRO396(c) | ||||||||
| GLN513 | PRO396(c) | THR395(Hb) | LEU392(c) | |||||
| VAL516 | PRO396(c) | PRO396(c) |