Skip to main content
. 2016 Apr 1;6:23910. doi: 10.1038/srep23910

Table 1. Causative variants detected in all solved families.

Fam (RP) Gene Nt Change Prot Change Status Cvg Mut Ref.
134 RPGR c.3168G > C p.R1056S Hem 320 Novel
234# EYS c.1971delT (*) p.S658Vfs*4 (*) Hem 360 11
    c.(1766 + 1_1767 − 1)_(2023 + 1_2024 − 1)del (*) NA Het  
258 NR2E3 c.194_202del p.N65_C67del Het 136 35
    c.967dupA p.M323Nfs*18 Het 400 Novel
298 ABCA4 c.3386G > T (*) p.R1129L (*) Het 392 36
    c.1819G > C p.G607R Het 443 37
356 USH2A c.10272_10273dupA (*) p.C3425Ffs*4 (*) Het 739 38
    c.10712C > T p.T3571M Het 721  
435 USH2A c.2276G > T (*) p.C759F (*) Het 899 39
    c.12569T > C p.V4190A Het 813 Novel
  CRB1 c.3988G > T (*) p.E1330* (*) Het 738 40
15# RPGR c.2405-2406delAG (*) p.E802Gfs*32 (*) Hem 174 41
95 BBS1 c.1169T > G p.M390R Het 401 23
    c.1474-2A > G NA Het 277 Novel
353 CRB1 c.2290C > T (*) p.R764C (*) Het 699 42
    c.2579delA p.N861Ifs*21 Het 860 Novel
359 PRPF8 c.6994dupG p.D2332Gfs*53 Het 363 Novel
488 BBS1 c.1169T > G (*) p.M390R (*) Het 629 23
    c.118delT p.C40Afs*2 Het 676 Novel
512 RS1 c.522 + 1G > C NA Hem 289 Novel
63 IMPDH1 c.402 + 57G > A NA Het 139 43
82 RP1 c.368_369dup p.P124Afs*20 Hom 269 44
118 CDH23 c.5816G > A p.R1939K Het 169 Novel
    c.7221C > A p.Y2407* Het 180 45
157 NMNAT1 c.197G > A p.R66Q Het 467 ExAC
    c.769G > A p.E257K Het 421 46
193 CEP290 c.5254C > T p.R1752W Hom 173 47
236 USH2A c.754G > T p.G252C Het 346 Novel
    c.4474G > T p.E1492* Het 329 48
    c.(9258 + 1_9259 − 1)_(11389 + 1_11390 − 1)del NA Het Novel
247 USH2A c.6937G > T p.G2313C Het 294 Rs1
    c.1000C > T (*) p.R334W (*) Het 304 49
264 PRPF3 c.1283-60_1283-57delATAT NA Het 29 Rs2
277 RDH12 c.295C > A (*) p.L99I (*) Het 292 50
    c.481C > T p.R161W Het 313 51
449 BBS2 c.1780C > T p.R594* Het 166 Novel
    c.471 + 1G > A NA Het 147 Novel
519 BBS10 c.1244delA p.H415Lfs*16 Het 258 52
    c.273C > G p.C91W Het 283 53
522 CRX c.(100 + 1_101 − 1)_(*1097_?)del NA Het Novel

Cvg Mut: coverage for each position. Asterisks “(*)”: variants previously detected by other techniques. Pads

“#”: families solved prior to this study. Rs1: rs199840367 and rs2: rs66790680. ExAC: Variant present in the Exome Aggregation Consortium.