Skip to main content
. 2016 Jan 29;6(4):779–791. doi: 10.1534/g3.115.025197

Table 2. Summary of putative presence/absence (P/A) polymorphisms in secreted and nonsecreted genes by chromosome.

Chromosome # Genes # Secreted Genes Proportion Secreted #Genes in P/A Proportion Genes P/A #Secreted Genes P/A Proportion Secreted PA
CC
 1 1774 163 0.09 135 0.08 13 0.08
 2 1069 98 0.09 124 0.12 19 0.19
 3 1012 112 0.11 85 0.08 13 0.12
 4 755 66 0.09 77 0.10 10 0.15
 5 781 80 0.10 88 0.11 12 0.15
 6 633 63 0.10 83 0.13 11 0.17
 7 774 79 0.10 129 0.17 12 0.15
 8 660 56 0.08 68 0.10 4 0.07
 9 564 59 0.10 78 0.14 7 0.12
 10 470 43 0.09 49 0.10 9 0.21
 11 465 50 0.11 62 0.13 5 0.10
 12 418 55 0.13 40 0.10 6 0.11
 13 328 34 0.10 50 0.15 5 0.15
AC
 14 158 6 0.04 135 0.85 4 0.67
 15 134 4 0.03 105 0.78 4 1.00
 16 134 3 0.02 97 0.72 2 0.67
 17 135 2 0.02 116 0.86 1 0.50
 18 110 5 0.02 23 0.21 0 0.00
 19 114 0 0.04 56 0.49 0 0.00
 20 117 2 0.00 106 0.91 2 1.00
 21 83 1 0.02 70 0.84 1 1.00
Total CC 9703 958 0.10 1068 0.11 126 0.13
Total AC 985 23 0.02 708 0.72 14 0.61

CC, Core chromosome; AC, accessory chromosome.