TABLE 1.
Organism identification | No. of isolates submitted by center: |
||
---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | |
N. abscessus complex and related species (NARS) (n = 10)a | 9 | 1 | |
N. abscessus (n = 2) | 2 | ||
N. arthritidis (n = 2) | 2 | ||
N. asiatica (n = 2) | 2 | ||
N. beijingensis (n = 3) | 3 | ||
N. pneumoniae (n = 4) | 4 | ||
N. brasiliensis (n = 13) | 8 | 1 | 4 |
N. brevicatena-N. paucivorans complex | |||
N. brevicatena (n = 1) | 1 | ||
N. paucivorans (n = 2) | 1 | 1 | |
N. cyriacigeorgica (n = 17) | 8 | 1 | 8 |
N. farcinica (n = 16) | 8 | 1 | 7 |
N. nova complex (n = 21)a | 16 | 5 | |
N. elegans (n = 2) | 2 | ||
N. kruczakiae (n = 3) | 2 | 1 | |
N. nova (n = 22) | 1 | 21 | |
N. veterana (n = 2) | 2 | ||
N. transvalensis complex | |||
N. transvalensis (n = 1) | 1 | ||
N. wallacei (n = 2) | 2 | ||
N. anaemiae (n = 2) | 2 | ||
N. asteroides sensu stricto (n = 1) | 1 | ||
N. blacklockiae (n = 2) | 2 | ||
N. exalbida (n = 1) | 1 | ||
N. mexicana (n = 3) | 3 | ||
N. niigatensis (n = 1) | 1 | ||
N. pseudobrasiliensis (n = 3) | 3 | ||
N. puris (n = 3) | 3 | ||
N. otitidiscaviarum (n = 4) | 1 | 3 | |
N. testacea complex | |||
N. testacea (n = 3) | 3 | ||
N. sienata (n = 0) | |||
N. thailandica (n = 1) | 1 | ||
Nocardia sp. (n = 1)b | 1 | ||
Total | 50 | 50 | 50 |
The isolates were identified only to the species complex level.
The species of the isolate could not be determined by 16S rRNA or secA sequence analysis.