Table 3. Analysis of the specificity and selectivity of the interaction between RNA methyltransferases and macro domain proteins.
| Yeast cotransformants | LT− | LTHA− | LTH−Ar+ | LT−+ X-α-gal | LTH− + 3AT (mM) |
|||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | 5 | 10 | 20 | |||||
| (a) HEV X-protein interaction with human RNA MethylTransferases | ||||||||
| AD X + BD CMTR1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD X + BD CMTR2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD X + BD RG9MTD1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD X + BD RNMT | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD + BD CMTR1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD + BD CMTR2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD + BD RG9MTD1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| AD + BD RNMT | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| (b) HEV Methyltransferase interaction with human macro domains | ||||||||
| BD Met + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD Met + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD Met + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD Met + AD C6orf130 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD Met + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD Met + AD C20orf133 | +++ | +++ | ++ | ++ | +++ | − | − | − |
| BD Met + AD LRP16 | +++ | + | − | − | +++ | − | − | − |
| BD Met + AD X | +++ | ++ | + | + | +++ | ++ | − | − |
| BD + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD C6orf130 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD C20orf133 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD LRP16 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD + AD X | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| (c) Interaction between human macro domains and RNA MethylTransferases | ||||||||
| BD CMTR1 + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD C6orf130 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD C20orf133 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR1 + AD LRP16 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD C6orf130 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD C20orf133 | +++ | ++ | ++ | ++ | +++ | − | − | − |
| BD CMTR2 + AD LRP16 | +++ | − | − | − | ++ | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD C6orf130 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD C20orf133 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RG9MTD1 + AD LRP16 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD GDAP2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD H2FYA2 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD MacroH2A1.1 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD C6orf130 | +++ | |||||||
| BD RNMT + AD PARP14 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD C20orf133 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
| BD RNMT + AD LRP16 | +++ | − | − | − | − | − | − | − |
Y2H gold strain was transformed in indicated combinations and plated on media lacking leucine, tryptophan (LT−). Eight random colonies from each cotransformants were replica plated onto media containing various selection markers, as indicated and their growth monitored over a period of four days. AD: Activation domain, BD: Binding domain, +++: Strong growth, ++: Moderate growth, +: Poor growth, −: No growth, L: Leucine, T: Tryptophan, H: Histidine, A: Adenine hemisulfate, Ar: Aureobasidin, 3-AT: 3-amino 1, 2, 4 Triazole, “−”: Deficiency in the medium, “+”: Supplemented in the medium.