Skip to main content
. 2016 Feb 22;291(16):8575–8590. doi: 10.1074/jbc.M116.718841

TABLE 2.

List of primers used for cloning and site-directed mutagenesis in this study

Primer Sequence (5′–3′) Length
bp
TodST-F AAA GGA TCC AGG AGA CAT ATG AGC TCC TTG GAT A 34
TodST-R TAT AAG CTT CTA TTC CAG GCT ATC CTT 27
TodSTpp-u TAT ATG CAT CTC GAG AAA CGA GCC CAG TAC 30
TodSTpp-m CCC TCT AGA AGC TTG CTA TTA CCT CTC TTC CAC C 34
mexCn-u AAA GAA TTC GCA AGA CAG GTT CGA TAA GGG TG 32
mexCn-d AAA GGA TCC AAT GCG CCC GGA GAT CGG 27
mexCc-u AAA GGA TCC GAT ATC CAG CAA CTC GAC CCG 30
mexCc-d TTT GCA TGC GTT TCT GCG CAG GCG CAA CG 29
Sm-N AAA GGA TCC AAG CTT GAA CCT TGA CCG AAC GCA 33
Sm-C ATA GGA TCC TTA TTT GCC GAC TAC CTT GGT GAT C 34
PAS1(23) NcoI-F CA ACC ATG GGA AAG GAG AAA GGA TCT GAA G 30
PAS1(43) NcoI-F CA ACC ATG GCG CTC TAC GAG TTT GTG 26
PAS1(168) XhoI-R CAA CTC GAG TCA CTC CAA TTC CTG GTT CTT C 31
TodS(23) BamHI-F C AAG GAT CCG ATG AAG GAG AAA GGA TCT G 29
TodS(978) XhoI-R CCG CTC GAG TGT GCC GGA GCC CTG TCT GG 29
L71M-F TG GAG GGG GGC GGG ATT ACT ATG GAA GAA ATA CGA GGG AAG 41
L71M-R CTT CCC TCG TAT TTC TTC CAT AGT AAT CCC GCC CCC CTC CA 41
F46A-F2 GAT GGG CTC TAC GAG GCC GTG GGC CTT CTT GAT G 34
F46A-R2 C ATC AAG AAG GCC CAC GGC CTC GTA GAG CCC ATC 34
V59A-F CT CAT GGA AAT GTG CTT GAA GCG AAC CAG GTC GCA TTG GAG GG 43
V59A-R CC CTC CAA TGC GAC CTG GTT CGC TTC AAG CAC ATT TCC ATG AG 43
A63V-F G CTT GAA GTG AAC CAG GTC GTA TTG GAG GGG GGC GGG ATT A 41
A63V-R T AAT CCC GCC CCC CTC CAA TAC GAC CTG GTT CAC TTC AAG C 41
F79Y-F GAA ATA CGA GGG AAG CCA TAC TGG AAG GCG CGT TGG TGG 39
F79Y-R CCA CCA ACG CGC CTT CCA GTA TGG CTT CCC TCG TAT TTC 39
W84V-F G AAG CCA TTC TGG AAG GCG CGT GTG TGG CAA ATT TCA AAA AAA ACC 46
W84V-R GGT TTT TTT TGA AAT TTG CCA CAC ACG CGC CTT CCA GAA TGG CTT C 46
W85H-F CCA TTC TGG AAG GCG CGT TGG CAT CAA ATT TCA AAA AAA ACC GAG 45
W85H-R CTC GGT TTT TTT TGA AAT TTG ATG CCA ACG CGC CTT CCA GAA TGG 45
W85R-F CCA TTC TGG AAG GCG CGT TGG CGT CAA ATT TCA AAA AAA ACC GAG 45
W85R-R CTC GGT TTT TTT TGA AAT TTG ACG CCA ACG CGC CTT CCA GAA TGG 45
I114V-F GAA TTT GTT CGC TGT GAT GTT GAG GTT CTT GGA AAA TCA GGT GGA AGA G 49
I114V-R C TCT TCC ACC TGA TTT TCC AAG AAC CTC AAC ATC ACA GCG AAC AAA TTC 49
V126A-F CA GGT GGA AGA GAG GTA ATA GCC GCC GAT TTT TCA TTG CTG CCA ATT TG 49
V126A-R CA AAT TGG CAG CAA TGA AAA ATC GGC GGC TAT TAC CTC TCT TCC ACC TG 49
F128L-F GA GAG GTA ATA GCC GTC GAT CTT TCA TTG CTG CCA ATT TGC 41
F128L-R GCA AAT TGG CAG CAA TGA AAG ATC GAC GGC TAT TAC CTC TC 41
A145V-F G AGC ATT GTT TAC CTT CTT GTG GAA GGG CGC AAT ATT ACC G 41
A145V-R C GGT AAT ATT GCG CCC TTC CAC AAG AAG GTA AAC AAT GCT C 41
L131D-F ATA GCC GTC GAT TTT TCA TTG GAT CCA ATT TGC AAT GAA GAA GGG 45
L131D-R CCC TTC TTC ATT GCA AAT TGG ATC CAA TGA AAA ATC GAC GGC TAT 45
V47L-F GAT GGG CTC TAC GAG TTT CTG GGC CTT CTT GAT GCT C 40
V47L-R G AGC ATC AAG AAG GCC CAG AAA CTC GTA GAG CCC ATC 40
L49D-F GG CTC TAC GAG TTT GTG GGC GAT CTT GAT GCT CAT GGA AAT G 42
L49D-R C ATT TCC ATG AGC ATC AAG ATC GCC CAC AAA CTC GTA GAG CC 42
E58A-F GCT CAT GGA AAT GTG CTT GCA GTG AAC CAG GTC GCA TTG 42
E58A-R CAA TGC GAC CTG GTT CAC TGC AAG CAC ATT TCC ATG AGC 42
E146A-F C ATT GTT TAC CTT CTT GCG GCA GGG CGC AAT ATT ACC GAT AA 42
E146A-R TT ATC GGT AAT ATT GCG CCC TGC CGC AAG AAG GTA AAC AAT G 42
E146L-F C ATT GTT TAC CTT CTT GCG CTG GGG CGC AAT ATT ACC GAT AA 42
E146L-R TT ATC GGT AAT ATT GCG CCC CAG CGC AAG AAG GTA AAC AATG 42
R148A-F C CTT CTT GCG GAA GGG GCA AAT ATT ACC GAT AAG AAG 37
R148A-R CTT CTT ATC GGT AAT ATT TGC CCC TTC CGC AAG AAG G 37
R148M-F C CTT CTT GCG GAA GGG ATG AAT ATT ACC GAT AAG AAG 37
R148M-R CTT CTT ATC GGT AAT ATT CAT CCC TTC CGC AAG AAG G 37
Y619A/E620A-F GCG CGT TGG AAA GCA GTG GCC GCC AAC TCT GCG GCC GGT ATT G 44
Y619A/E620A-R C AAT ACC GGC CGC AGA GTT GGC GGC CAC TGC TTT CCA ACG CGC 43
Δ617–623-F CCG CCT CGG AAG CGC GTT GGA AAG CCG GTA TTG TAC TGA CCG ACC 45
Δ617–623-R GGT CGG TCA GTA CAA TAC CGG CTT TCC AAC GCG CTT CCG AGG CGG 45
E666A-F CTG ACT CCA TCT GAC GCA AGC CCA CAG ATA AAG C 34
E666A-R G CTT TAT CTG TGG GCT TGC GTC AGA TGG AGT CAG 34
L674A-F CAG ATA AAG CAG CGT GCA GCC AAT TTG CTT CAG 32
L674A-R CTG AAG CAA ATT GGC TGC ACG CTG CTT TAT CTG 32
Y691I-F C AGT GTG GAG CGC TCC ATT CTA TGC AAA AAT GGT TC 36
Y691I-R GA ACC ATT TTT GCA TAG AAT GGA GCG CTC CAC ACT G 36
A703S-F CT ACG ATT TGG GCC AAT TCG AGT GTC TCG CTG ATG 35
A703S-R CAT CAG CGA GAC ACT CGA ATT GGC CCA AAT CGT AG 35