Table 4. Linkage disequilibrium (LD) statistics per chromosome.

Chromosome	Number SNPs	D'	r2	Average distance (kb)	Min. distance (kb)	Max. distance (kb)
CHI 1	2921	0.47	0.11	53.04	1.82	280.97
CHI 2	2553	0.48	0.11	53.03	3.97	304.22
CHI 3	2134	0.46	0.11	54.73	8.16	306.69
CHI 4	2243	0.46	0.1	51.67	2.09	280
CHI 5	2025	0.47	0.11	54.79	3.68	431.32
CHI 6	2132	0.51	0.13	53.63	0.002	330
CHI 7	1995	0.49	0.12	53.43	4.51	333.29
CHI 8	2150	0.47	0.12	51.67	3.52	277.69
CHI 9	1735	0.45	0.1	51.98	6.31	236.99
CHI 10	1908	0.48	0.12	51.83	3.69	279.79
CHI 11	1963	0.48	0.12	53.56	3.38	260
CHI 12	1575	0.48	0.12	53.1	3.68	423.82
CHI 13	1509	0.48	0.11	53.44	0.03	393.85
CHI 14	1746	0.46	0.1	51.67	2.09	280
CHI 15	1494	0.47	0.11	52.89	2.46	434.35
CHI 16	1452	0.51	0.13	53.63	0.002	330
CHI 17	1363	0.46	0.1	52.62	3.57	475.02
CHI 18	1122	0.51	0.13	54.4	2.08	450.14
CHI 19	1099	0.47	0.11	56.37	7.34	276.3
CHI 20	1352	0.47	0.11	52.6	2.12	245.49
CHI 21	1276	0.47	0.11	52.24	1.09	237.6
CHI 22	1067	0.49	0.11	54.19	3.53	303.7
CHI 23	924	0.47	0.12	53.33	6.05	255.16
CHI 24	1206	0.48	0.11	50.99	3.67	327.87
CHI 25	757	0.45	0.09	54.69	4.46	750.33
CHI 26	964	0.44	0.11	51.96	6.11	394.97
CHI 27	852	0.45	0.11	51.68	5.78	382.71
CHI 28	839	0.45	0.09	51.27	1.04	258.99
CHI 29	880	0.43	0.09	54.97	3.46	241.85
Average		0.47	0.11	53.08	3.44	337.35