Skip to main content
. 2016 May 12;11(5):e0154353. doi: 10.1371/journal.pone.0154353

Table 5. Mean pairwise linkage disequilibrium (LD) estimates for different inter-SNP distance intervals.

Distance interval (kb) Mean r2 ± SD
Argentina France South Africa Total
0–10 0.35 ± 0.207 0.36 ± 0.221 0.38 ± 0.228 0.32 ± 0.199
10–20 0.20 ± 0.101 0.23 ± 0.119 0.23 ± 0.118 0.17 ± 0.086
20–40 0.16 ± 0.015 0.19 ± 0.020 0.19 ± 0.019 0.13 ± 0.015
40–60 0.14 ± 0.013 0.18 ± 0.015 0.18 ± 0.018 0.11 ± 0.009
60–100 0.13 ± 0.011 0.16 ± 0.015 0.16 ± 0.013 0.09 ± 0.010
100–200 0.11 ± 0.008 0.14 ± 0.014 0.14 ± 0.010 0.08 ± 0.006
200–500 0.10 ± 0.007 0.13 ± 0.013 0.13 ± 0.009 0.07 ± 0.006
500-1Mb 0.09 ± 0.007 0.12 ± 0.013 0.11 ± 0.008 0.06 ± 0.005