Skip to main content
. 2016 May 12;8:54. doi: 10.1186/s13148-016-0219-0

Table 3.

Significant mediating effects of gene methylation on IL-2 outcome

Gene CpG site DNA methylation IL-2 outcome Mediation effect
R 2 Storm32 R 2 DNA methylation Storm32
Effect (a) SE p val. Effect (b) SE p val. Effect (c') SE p val. Effect (a*b) Boot SE Boot LLCI Boot ULCI Standardized Effect
DDR1 cg11975790 0.1813 0.0527 0.0201 0.0135 0.1458 0.2919 0.1926 0.1402 0.0209 0.0238 0.3882 0.0154 0.0109 0.0001 0.0449 0.12033
LCK cg05350315 0.1949 0.0711 0.0260 0.0101 0.1468 0.2279 0.1492 0.1372 0.0201 0.0240 0.4104 0.0162 0.0123 0.0001 0.0504 0.126718
LTA cg21999229 0.2593 0.1120 0.0340 0.0025 0.1579 0.1881 0.1132 0.1071 0.0152 0.0249 0.5459 0.0211 0.0131 0.0015 0.0559 0.164705
cg14597739 0.2618 0.1198 0.0361 0.0023 0.2009 0.2206 0.1037 0.0418 0.0098 0.0243 0.6884 0.0264 0.0145 0.0061 0.0681 0.206707
cg16219283 0.2575 0.1038 0.0316 0.0026 0.1693 0.2163 0.1208 0.0833 0.0138 0.0247 0.5799 0.0224 0.0142 0.0020 0.0620 0.175555
cg17169196 0.2233 0.0894 0.0299 0.0055 0.1498 0.2020 0.1292 0.1284 0.0182 0.0244 0.4616 0.0181 0.0134 0.0000 0.0566 0.141177
cg02402436 0.2261 0.0932 0.0310 0.0052 0.1701 0.2221 0.1234 0.0818 0.0156 0.0242 0.5244 0.0207 0.0113 0.0038 0.0528 0.161848
cg14441276 0.2038 0.0741 0.0263 0.0084 0.1522 0.2338 0.1467 0.1216 0.0189 0.0241 0.4380 0.0173 0.0119 0.0004 0.0513 0.135532
TGFBR2 cg04916416 0.1641 0.0412 0.0167 0.0193 0.1289 0.3029 0.2346 0.2065 0.0238 0.0238 0.3259 0.0125 0.0090 0.0006 0.0370 0.097494

None of the mediation effects survived Bonferroni correction