Skip to main content
. 2016 May 12;8:54. doi: 10.1186/s13148-016-0219-0

Table 4.

Significant mediating effects of gene methylation on IL-4 outcome

Gene CpG site DNA methylation IL-4 outcome Mediation effect
R 2 Storm32 R 2 DNA methylation Storm32
Effect (a) SE p val. Effect (b) SE p val. Effect (c') SE p val. Effect (a*b) Boot SE Boot LLCI Boot ULCI Standardized effect
BCL10 cg01636910 0.1332 −0.0506 0.0232 0.0367 0.2035 −0.2347 0.1441 0.1139 0.0297 0.0200 0.1466 0.0119 0.0091 0.0006 0.0368 0.104041
IGF1R cg13297560 0.1322 0.0388 0.0178 0.0375 0.2072 0.3125 0.1866 0.1044 0.0295 0.0199 0.1489 0.0121 0.0093 0.0004 0.0386 0.106277
LCK cg17078393 0.2561 0.0659 0.0202 0.0027 0.2394 0.3308 0.1616 0.0495 0.0198 0.0211 0.3547 0.0218 0.0132 0.0037 0.0563 0.191284
cg05350315 0.1949 0.0711 0.0260 0.0101 0.2457 0.2648 0.1252 0.0428 0.0228 0.0202 0.2673 0.0188 0.0119 0.0029 0.0524 0.165089
MAP3K14 cg16826777 0.1665 −0.0516 0.0207 0.0184 0.2167 −0.2857 0.1597 0.0838 0.0269 0.0202 0.1931 0.0147 0.0093 0.0018 0.0396 0.129202
PIK3CD cg07499142 0.1747 0.0599 0.0234 0.0155 0.2021 0.2300 0.1429 0.1178 0.0278 0.0205 0.1842 0.0138 0.0090 0.0003 0.0373 0.120821
PIK3R2 cg11953794 0.2101 −0.0753 0.0262 0.0073 0.2113 −0.2185 0.1267 0.0949 0.0252 0.0208 0.2359 0.0164 0.0105 0.0001 0.0403 0.144195
cg04610450 0.1700 −0.0442 0.0176 0.0171 0.2008 −0.3036 0.1904 0.1214 0.0282 0.0204 0.1780 0.0134 0.0094 0.0003 0.0389 0.117742
PRKCZ cg02481000 0.1183 −0.0434 0.0213 0.0501 0.2340 −0.3056 0.1538 0.0560 0.0283 0.0194 0.1546 0.0133 0.0099 0.0007 0.0412 0.11632
TLR6 cg14578677 0.1978 −0.0707 0.0256 0.0095 0.2094 −0.2213 0.1301 0.0992 0.0260 0.0207 0.2187 0.0156 0.0116 0.0008 0.0470 0.137144
TNFRSF1B cg05599723 0.1221 −0.0465 0.0224 0.0462 0.2060 −0.2470 0.1488 0.1075 0.0301 0.0198 0.1387 0.0115 0.0086 0.0003 0.0350 0.100689
ZAP70 cg08859278 0.1844 0.0475 0.0179 0.0126 0.2172 0.3310 0.1844 0.0828 0.0259 0.0204 0.2142 0.0157 0.0093 0.0019 0.0405 0.137839

None of the mediation effects survived Bonferroni correction