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. 2016 May 25;17:399. doi: 10.1186/s12864-016-2698-y

Table 2.

Preprocessing statistics

Trimming R1 Trimming R2 Mapped Joined
Sample reads bases reads bases reads reads
HG3CD5n_cl1 19,9 % 9,0 22,4 % 22,2 93,7 % 80,5 %
HG3CD5p_cl7 20,0 % 8,8 22,4 % 22,1 93,6 % 82,4 %
U2932R1 20,1 % 8,9 22,1 % 21,8 93,5 % 81,9 %
U2932R2 20,0 % 8,9 22,6 % 22,8 93,7 % 80,1 %
WAC3CD5n 22,6 % 8,9 20,0 % 22,4 93,5 % 80,6 %
WAC3CD5p 20,0 % 9,0 22,4 % 21,8 93,7 % 81,6 %
HG3CD5n_cl41 14,6 % 12,8 12,7 % 43,1 90,5 % 38,0 %
HG3CD5n_cl48 14,5 % 12,6 12,5 % 42,7 90,3 % 47,1 %
HG3CD5n_mix 14,3 % 12,5 12,1 % 41,9 90,6 % 50,8 %
HG3CD5p_mix 13,7 % 12,3 11,9 % 42,4 91,0 % 46,8 %
NCNC 14,6 % 12,7 12,4 % 43,7 89,2 % 43,8 %
WAOSEL 13,3 % 15,9 10,3 % 42,4 88,0 % 44,4 %