Skip to main content
. 2016 May 26;7:774. doi: 10.3389/fmicb.2016.00774

Table 1.

Average isotope and elemental ratio properties for all cellular ROIs, the FISH-identified Delta- and Gammaproteobacteria, and the five cluster, fuzzy c-means solutions for all incubation and control experiments.

All Delta Gamma a b c d e
2 DAYS:13C-ACETATE + 15NH4+ + 33SO42-
Number of ROIs 665 20 645 253 107 257 30 18
13C/12C 0.1432 0.1817 0.1421 0.0625 0.2284 0.1889 0.1086 0.1757
sd 0.0915 0.1098 0.0915 0.0363 0.1024 0.0580 0.0486 0.0974
12C15N/12C14N 0.0394 0.0447 0.0393 0.0187 0.0569 0.0508 0.0370 0.0704
sd 0.0216 0.0169 0.0216 0.0112 0.0158 0.0123 0.0167 0.0259
33S/32S 0.0139 0.0187 0.0138 0.0094 0.0164 0.0141 0.0122 0.0622
sd 0.0106 0.0065 0.0106 0.0028 0.0070 0.0056 0.0051 0.0245
C/CN 0.4080 0.4286 0.4073 0.4239 0.5943 0.3383 0.2667 0.3066
sd 0.1405 0.1219 0.1405 0.1159 0.1267 0.0830 0.0842 0.1191
S/CN 0.1187 0.1032 0.1192 0.1084 0.1415 0.1028 0.2554 0.1281
sd 0.0452 0.0222 0.0452 0.0219 0.0213 0.0206 0.1106 0.0268
7 DAYS:13C-ACETATE + 15NH4+ + 33SO42-
Number of ROIs 777 53 724 443 136 106 32 60
13C/12C 0.0984 0.0727 0.0760 0.0304 0.0499 0.2687 0.0694 0.1323
sd 0.0335 0.0506 0.1009 0.0298 0.0385 0.1112 0.0397 0.0850
12C15N/12C14N 0.0283 0.0688 0.0214 0.0105 0.0157 0.0532 0.0217 0.1001
sd 0.0309 0.0471 0.0235 0.0105 0.0100 0.0125 0.0103 0.0162
33S/32S 0.0620 0.1292 0.0259 0.0151 0.0150 0.0306 0.0078 0.2229
sd 0.4579 0.1224 0.0481 0.0109 0.0102 0.0249 0.0016 0.0899
C/CN 0.2067 0.2726 0.4715 0.3736 0.7612 0.5187 0.4769 0.2759
sd 0.1113 0.1608 0.2032 0.1042 0.1953 0.1529 0.2435 0.1203
S/CN 0.0564 0.0880 0.1130 0.0886 0.1509 0.1188 0.3125 0.0690
sd 0.0593 0.0873 0.0531 0.0193 0.0326 0.0275 0.0815 0.0193
10 DAYS:13C-ACETATE + 15NH4+ + 33SO42-
Number of ROIs 760 340 420 306 0 158 66 230
13C/12C 0.1040 0.0938 0.1123 0.0655 n.d. 0.1943 0.0910 0.0968
sd 0.0649 0.0487 0.0746 0.0385 n.d 0.0638 0.0452 0.0307
12C15N/12C14N 0.0531 0.0628 0.0454 0.0379 n.d. 0.0561 0.0448 0.0739
sd 0.0222 0.0203 0.0207 0.0207 n.d 0.0104 0.0196 0.0106
33S/32S 0.0425 0.0578 0.0302 0.0146 n.d. 0.0285 0.0446 0.0887
sd 0.0377 0.0430 0.0270 0.0169 n.d. 0.0233 0.0283 0.0199
C/CN 0.4303 0.3493 0.4960 0.3113 n.d. 0.5350 0.8700 0.3907
sd 0.2528 0.1787 0.2832 0.1853 n.d. 0.1987 0.3895 0.1100
S/CN 0.0792 0.0804 0.0783 0.0648 n.d. 0.0650 0.1660 0.0833
sd 0.0436 0.0370 0.0482 0.0243 n.d. 0.0134 0.0905 0.0213
UNLABELED CONTROL (7 DAYS): ACETATE + NH4+ + SO42-
Number of ROIs 645 23 622 155 133 39 193 125
13C/12C 0.0109 0.0109 0.0109 0.0109 0.0105 0.0106 0.0109 0.0112
sd 0.0005 0.0004 0.0005 0.0003 0.0003 0.0004 0.0003 0.0003
12C15N/12C14N 0.0035 0.0035 0.0035 0.0036 0.0034 0.0034 0.0034 0.0034
sd 0.0002 0.0001 0.0002 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
33S/32S 0.0072 0.0074 0.0072 0.0074 0.0074 0.0092 0.0068 0.0067
sd 0.0008 0.0005 0.0008 0.0004 0.0004 0.0009 0.0003 0.0002
C/CN 0.3362 0.4385 0.3324 0.3687 0.4739 0.4149 0.1868 0.3557
sd 0.1507 0.1484 0.1507 0.0891 0.1442 0.1209 0.0701 0.1202
S/CN 0.1101 0.1167 0.1099 0.0656 0.0697 0.0652 0.1103 0.2220
sd 0.0691 0.0847 0.0691 0.0168 0.0274 0.0213 0.0387 0.0607
KILLED CONTROL (10 DAYS): 13C-ACETATE + 15NH4+ + 15NO3-+ 33SO42-
Number of ROIs 268 32 236 110 79 55 13 11
13C/12C 0.0123 0.0143 0.0120 0.0115 0.0123 0.0116 0.0120 0.0241
sd 0.0032 0.0027 0.0032 0.0015 0.0015 0.0010 0.0009 0.0060
12C15N/12C14N 0.0045 0.0046 0.0045 0.0046 0.0041 0.0044 0.0064 0.0048
sd 0.0007 0.0004 0.0007 0.0004 0.0003 0.0003 0.0008 0.0005
33S/32S 0.0057 0.0056 0.0057 0.0049 0.0063 0.0061 0.0066 0.0061
sd 0.0011 0.0011 0.0011 0.0009 0.0007 0.0008 0.0015 0.0003
C/CN 0.3114 0.3128 0.3112 0.3165 0.1999 0.4473 0.2845 0.4123
sd 0.1325 0.0370 0.1325 0.0729 0.0935 0.1433 0.0504 0.0903
S/CN 0.0917 0.0800 0.0933 0.0738 0.0855 0.1433 0.0684 0.0841
sd 0.0429 0.0373 0.0429 0.0137 0.0255 0.0618 0.0287 0.0225

Gamma, Gammaproteobacteria; Delta, Deltaproteobacteria; sd, standard deviation; n.d., not detected.