Table 3.
Site | Sample | Poly α | TA109 | PfPK2 | ARA2 | Pfg377 | TA42 | TA81 | TA1 | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Kolle | T10 | 166 | 163 | 157 | 183 | 168 | 171 | 76 | 82 | 104 | 107 | 192 | 125 | 128 | 168 | 180 | |||||||||||||
Kolle | T11 | 157 | 171 | 180 | 67 | 104 | 207 | 143 | 180 | ||||||||||||||||||||
Kolle | T12 | 160 | 168 | 165 | 76 | 107 | 207 | 125 | 174 | ||||||||||||||||||||
Kolle | T13 | 157 | 136 | 180 | 180 | 64 | 104 | 192 | 137 | 180 | |||||||||||||||||||
Kolle | T15 | 157 | 192 | 168 | 73 | 104 | 192 | 131 | 180 | 168 | |||||||||||||||||||
Kolle | T16 | 157 | 183 | 165 | 70 | 104 | 192 | 131 | 171 | ||||||||||||||||||||
Kolle | T17 | 154 | 183 | 195 | 180 | 67 | 104 | 192 | 131 | 137 | 168 | 189 | |||||||||||||||||
Kolle | T18 | 169 | 183 | 171 | 165 | 183 | 64 | 70 | 104 | 183 | 131 | 183 | 180 | ||||||||||||||||
Kolle | T19 | 148 | 166 | 183 | 171 | 168 | 174 | 82 | 70 | 67 | 107 | 207 | 192 | 125 | 131 | 189 | 174 | 183 | |||||||||||
Kolle | T129 | 163 | 180 | 177 | 67 | 107 | 192 | 134 | 171 | ||||||||||||||||||||
Kolle | T130 | 163 | 180 | 168 | 107 | 192 | 125 | 165 | |||||||||||||||||||||
Kolle | T131 | 163 | 213 | 177 | 82 | 107 | 192 | 131 | 174 | ||||||||||||||||||||
Samako | T20 | 168 | 180 | 171 | 107 | 192 | 128 | ||||||||||||||||||||||
Samako | T21 | 163 | 168 | 183 | 174 | 168 | 70 | 67 | 107 | 192 | 131 | 125 | 180 | ||||||||||||||||
Samako | T22 | 163 | 157 | 180 | 174 | 82 | 107 | 207 | 128 | 174 | |||||||||||||||||||
Samako | T23 | 169 | 172 | 157 | 168 | 180 | 171 | 70 | 64 | 104 | 107 | 192 | 134 | 143 | 168 | 177 | 189 | ||||||||||||
Samako | T24 | 180 | 198 | 174 | 104 | 192 | 128 | 189 | 186 | ||||||||||||||||||||
Samako | T25 | 151 | 160 | 183 | 174 | 171 | 67 | 79 | 104 | 192 | 128 | 131 | 165 | 168 | |||||||||||||||
Samako | T26 | 157 | 168 | 174 | 171 | 64 | 79 | 107 | 192 | 128 | 125 | 183 | 180 | ||||||||||||||||
Samako | T28 | 154 | 157 | 186 | 201 | 177 | 174 | 73 | 104 | 192 | 137 | 168 | 171 | ||||||||||||||||
Samako | T124 | 157 | 142 | 166 | 175 | 168 | 183 | 180 | 198 | 168 | 171 | 70 | 64 | 67 | 82 | 107 | 192 | 207 | 125 | 131 | 165 | 171 | 189 | 198 | |||||
Samako | T125 | 109 | 168 | 182 | 168 | 174 | 180 | 82 | 73 | 104 | 113 | 192 | 131 | 137 | 171 | 189 | |||||||||||||
Samako | T126 | 157 | 168 | 177 | 70 | 107 | 192 | 131 | 180 | ||||||||||||||||||||
Samako | T127 | 157 | 172 | 189 | 180 | 168 | 165 | 195 | 73 | 64 | 107 | 207 | 192 | 183 | 125 | 183 | 165 | ||||||||||||
Djoliba | T29 | 178 | 180 | 177 | 73 | 107 | 192 | 131 | 177 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T30 | 169 | 168 | 174 | 79 | 104 | 207 | 131 | 165 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T31 | 154 | 186 | 189 | 73 | 107 | 192 | 128 | 174 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T32 | 169 | 154 | 171 | 186 | 168 | 76 | 107 | 192 | 137 | 125 | 180 | |||||||||||||||||
Djoliba | T33 | 160 | 157 | 168 | 180 | 171 | 165 | 76 | 104 | 107 | 192 | 134 | 128 | 177 | 165 | ||||||||||||||
Djoliba | T34 | 163 | 183 | 192 | 94 | 107 | 207 | 131 | 174 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T35 | 172 | 184 | 168 | 174 | 171 | 195 | 70 | 107 | 192 | 189 | 128 | 174 | ||||||||||||||||
Djoliba | T36 | 157 | 180 | 183 | 171 | 165 | 70 | 104 | 207 | 222 | 131 | 137 | 171 | 183 | |||||||||||||||
Djoliba | T37 | 163 | 204 | 171 | 85 | 107 | 207 | 122 | 174 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T38 | 163 | 184 | 195 | 183 | 171 | 174 | 177 | 73 | 107 | 192 | 128 | 171 | ||||||||||||||||
Djoliba | T39 | 115 | 160 | 159 | 168 | 171 | 70 | 104 | 192 | 125 | 170 | 174 | |||||||||||||||||
Djoliba | T40 | 154 | 166 | 153 | 171 | 76 | 73 | 113 | 207 | 131 | 171 | ||||||||||||||||||
Djoliba | T41 | 178 | 183 | 168 | 73 | 107 | 192 | 125 | 128 | 174 | |||||||||||||||||||
Djoliba | T42 | 154 | 207 | 171 | 168 | 94 | 64 | 73 | 107 | 192 | 131 | 183 | 171 | ||||||||||||||||
Djoliba | T43 | 169 | 160 | 180 | 180 | 165 | 79 | 107 | 207 | 125 | 171 | ||||||||||||||||||
Djoliba | T44 | 175 | 171 | 165 | 79 | 104 | 192 | 125 | 183 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T45 | 184 | 189 | 174 | 70 | 101 | 192 | 125 | 174 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T46 | 157 | 183 | 73 | 207 | 140 | 174 | ||||||||||||||||||||||
Djoliba | T47 | 148 | 180 | 171 | 73 | 110 | 192 | 125 | 168 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T48 | 160 | 171 | 165 | 171 | 79 | 70 | 101 | 107 | 195 | 143 | 134 | 174 | ||||||||||||||||
Djoliba | T50 | 157 | 160 | 163 | 183 | 171 | 186 | 204 | 168 | 171 | 174 | 76 | 67 | 70 | 104 | 101 | 107 | 192 | 131 | 128 | 134 | 165 | 174 | 168 | 177 | ||||
Djoliba | T51 | 166 | 171 | 174 | 70 | 107 | 192 | 140 | 165 | ||||||||||||||||||||
Djoliba | T52 | 157 | 183 | 168 | 183 | 177 | 171 | 76 | 67 | 107 | 192 | 125 | 168 | ||||||||||||||||
Djoliba | T54 | 154 | 180 | 198 | 162 | 76 | 104 | 192 | 207 | 128 | 171 | ||||||||||||||||||
Djoliba | T55 | 160 | 154 | 168 | 168 | 177 | 76 | 107 | 104 | 192 | 125 | 128 | 134 | 171 | 168 | ||||||||||||||
Djoliba | T56 | 169 | 162 | 186 | 177 | 70 | 107 | 192 | 207 | 128 | 189 | 177 | |||||||||||||||||
Djoliba | T57 | 157 | 168 | 171 | 73 | 107 | 192 | 116 | 128 | 165 | |||||||||||||||||||
Djoliba | T58 | 160 | 178 | 177 | 189 | 174 | 70 | 64 | 107 | 192 | 207 | 125 | 168 | 174 | |||||||||||||||
Djoliba | T59 | 142 | 183 | 189 | 168 | 76 | 67 | 107 | 192 | 125 | 177 | 183 | |||||||||||||||||
Bougoula | T133 | 160 | 183 | 186 | 76 | 107 | 192 | 116 | 171 | ||||||||||||||||||||
Bougoula | T134 | 157 | 201 | 128 | 125 | 132 | |||||||||||||||||||||||
Bougoula | T135 | 151 | 154 | 180 | 183 | 192 | 85 | 73 | 107 | 192 | 125 | 171 | |||||||||||||||||
Bougoula | T137 | 181 | 171 | 171 | 82 | 107 | 113 | 192 | 204 | 207 | 128 | 168 | |||||||||||||||||
Bougoula | T138 | 166 | 154 | 168 | 183 | 168 | 180 | 76 | 70 | 82 | 107 | 92 | 192 | 125 | 171 | ||||||||||||||
Bougoula | T139 | 157 | 166 | 177 | 168 | 168 | 76 | 70 | 107 | 192 | 128 | 165 | 174 | ||||||||||||||||
Bougoula | T140 | 151 | 171 | 168 | 180 | 171 | 70 | 107 | 192 | 207 | 134 | 131 | 177 | 180 | 174 | ||||||||||||||
Bougoula | T141 | 160 | 157 | 165 | 192 | 168 | 165 | 82 | 107 | 192 | 131 | 134 | 128 | 174 | |||||||||||||||
Bougoula | T144 | 151 | 189 | 174 | 70 | 104 | 192 | 122 | 183 | ||||||||||||||||||||
Bougoula | T146 | 168 | 186 | 64 | 107 | 192 | 128 | 134 | 171 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T1 | 169 | 177 | 174 | 82 | 104 | 192 | 134 | 128 | 171 | |||||||||||||||||||
Bamako | T3 | 154 | 178 | 189 | 174 | 70 | 104 | 207 | 128 | 201 | |||||||||||||||||||
Bamako | T6 | 166 | 165 | 168 | 70 | 82 | 104 | 192 | 131 | 186 | |||||||||||||||||||
Bamako | T7 | 139 | 180 | 165 | 70 | 110 | 207 | 128 | 168 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T9 | 154 | 189 | 168 | 67 | 98 | 192 | 134 | 128 | 174 | |||||||||||||||||||
Bamako | T155 | 180 | 171 | 76 | 107 | 192 | 140 | 171 | |||||||||||||||||||||
Bamako | T156 | 157 | 171 | 168 | 70 | 73 | 107 | 192 | 134 | 186 | |||||||||||||||||||
Bamako | T157 | 157 | 168 | 171 | 79 | 104 | 192 | 131 | 165 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T159 | 169 | 168 | 174 | 76 | 107 | 207 | 131 | 180 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T160 | 139 | 171 | 165 | 70 | 73 | 110 | 207 | 125 | 131 | 174 | 165 | |||||||||||||||||
Bamako | T162 | 172 | 183 | 186 | 171 | 162 | 64 | 73 | 101 | 107 | 192 | 125 | 134 | 177 | |||||||||||||||
Bamako | T163 | 172 | 183 | 171 | 76 | 104 | 192 | 128 | 177 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T171 | 178 | 168 | 165 | 70 | 110 | 95 | 192 | 128 | 174 | |||||||||||||||||||
Bamako | T172 | 157 | 171 | 180 | 174 | 67 | 73 | 104 | 110 | 192 | 131 | 168 | 180 | ||||||||||||||||
Bamako | T174 | 166 | 183 | 171 | 70 | 107 | 192 | 128 | 186 | ||||||||||||||||||||
Bamako | T176 | 163 | 183 | 171 | 76 | 104 | 89 | 192 | 134 | 192 | |||||||||||||||||||
Bamako | T177 | 154 | 183 | 177 | 131 | ||||||||||||||||||||||||
Bamako | T178 | 154 | 157 | 168 | 177 | 73 | 107 | 92 | 192 | 125 | 180 | ||||||||||||||||||
Bamako | T179 | 160 | 180 | 168 | 79 | 107 | 92 | 192 | 128 | 177 | |||||||||||||||||||
Bamako | T180 | 157 | 169 | 148 | 180 | 168 | 183 | 177 | 171 | 180 | 73 | 76 | 85 | 107 | 192 | 125 | 171 | 174 |
The allele length (in base pairs) for each Plasmodium falciparum tested loci (Poly α, TA109, TA1, TA81, TA42, ARA2, PfPK2, and Pfg377) is provided. The empty cells of the table correspond to negative loci.